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Portal:Folding@Home/Cores

2008-03-30T08:30:18Z

Affenkopf: /* Gromacs Simulated Tempering */

[[Portal:Folding@Home|Folding@Home]] untersucht ein breites Spektrum an Problemen und verwendet dabei viele verschiedene Verfahren. Aus diesem Grund gibt es bei diesem Projekt mehrere Arten von [[Work-Unit|Work-Units]], die sich untereinander vor allem in den zur Lösung verwendeten Algorithmen unterscheiden. Jeder [[Work-Unit|WU]]-Typ wird von einem eigenen [[Core]] berechnet. Insgesamt gibt es bei Folding@Home derzeit 12 Cores.

== Tinker ==

Der '''Tinker''' Core ist der älteste Core. Er wurde inzwischen durch den moderneren [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Core und seine verschiedenen Derivate abgelöst.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_65.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:''' keine
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (PowerPC)

== Gromacs ==

Der '''Gromacs''' Core hat zusammen mit seinen Derivaten den [[Portal:Folding@Home/Cores#Tinker|Tinker]] Core abgelöst und ist nun der am häufigsten verwendete Core. Er basiert auf der gleichnamigen Anwendung, welche von der University of Groningen unter der GPL-Lizenz entwickelt wird. Er kann die [[SIMD]]-Erweiterungen moderner CPUs nutzen.

Gromacs ist die Abkürzung für '''Gro'''ningen '''Ma'''chine for '''C'''hemical '''S'''imulations.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_78.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE]]
** [[3DNow!]]
** [[AltiVec]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (PowerPC)

== Double Gromacs ==

Der '''Double Gromacs''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Cores, welches doppelte statt einfacher Genauigkeit verwendet.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_79.exe
* '''Genauigkeit:''' doppelt
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE2]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (PowerPC)

== Double Gromacs B ==

Der '''Double Gromacs B''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Double Gromacs|Double Gromacs]] Cores, welches um einige wissenschaftliche Verfahren erweitert wurde.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_7B.exe
* '''Genauigkeit:''' doppelt
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE2]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (PowerPC)

== GBGromacs ==

Der '''GBGromacs''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Cores, welches um das "Generalized Born implicit solvent"-Verfahren erweitert wurde.

GBGromacs ist die Abkürzung für '''G'''eneralized '''B'''orn '''Gromacs'''.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_7A.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach(?)
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:''' ?
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (PowerPC)

== Gromacs 33 ==

Der '''Gromacs 33''' Core ist ein aktualisierter [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Core. Er basiert auf Version 3.3 der Gromacs-Anwendung der University of Groningen.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_A0.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach(?)
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (x86)

== Gromacs SREM ==

Der '''Gromacs SREM''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Cores, welches um das "Replica Exchange"-Verfahren erweitert wurde.

SREM ist die Abkürzung für '''S'''erial '''R'''eplica '''E'''xchange '''M'''ethod.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_80.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach(?)
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:''' ?
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)

== Gromacs Simulated Tempering ==

Der '''GROSimT''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Cores, welches um den "Simulated Tempering"-Algorithmus erweitert wurde.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_81.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach(?)
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Linux (x86)
** Windows (x86)

== Gromacs SMP ==

Der '''Gromacs SMP''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Cores, welches für Multiprozessorsysteme ([[SMP]]) angepasst wurde. Der Core benötigt ein System mit mindestens zwei Prozessorkernen. Optimiert wurde er auf 4 Kerne.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_A1.exe, FahCore_A2.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' ja
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86) - nur Version 1.74 (FahCore_A1.exe)
** Linux (x86-64)
** MacOS X (x86)

== GPU Gromacs ==

Der [[GPU]]-Client verwendet einen Core, der im Wesentlichen ein sehr stark veränderter [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Core ist. Er läuft nicht auf der CPU, sondern nutzt die Shader moderner Grafikchips, welche aufgrund ihrer sehr starken Spezialisierung um ein vielfaches schneller sind als eine CPU.

Derzeit werden nur Grafikchips von ATI/AMD unterstützt. Eine Version für NVIDIA-Chips ist geplant.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_10.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' ja (Crossfire)
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
* '''unterstützte Grafikchips:'''
** AMD R520 (X1800)
** AMD RV530 (X1650)
** AMD RV570 (X1650 XT, X1950)
** AMD R580 (X19xx)

== AMBER ==

Der '''AMBER''' Core ist ein Programm zur Berechnung von Moleküldynamiken, welches ursprünglich von der University of California entwickelt wurde und nun vom Scripps Research Institute weiterentwickelt wird.

AMBER ist die Abkürzung für '''A'''ssisted '''M'''odel '''B'''uilding and '''E'''nergy '''R'''efinement.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_82.exe
* '''Genauigkeit:''' doppelt
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:''' keine ([[SSE2]] geplant)
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)

== QMD ==

Der '''QMD''' Core nutzt einen quantenchemischen Ansatz und basiert auf dem CPMD-Programm, welches von verschiedenen weltweit verteilten Einrichtungen entwickelt wird. Er ist Multithreading-fähig.

Da der verwendete Intel Fortran Compiler auf AMD-CPUs absichtlich kein [[SSE2]] verwendet und Intel es nicht erlaubt, diese Einschränkung zu umgehen, laufen QMD-WUs auf AMD-Prozessoren sehr langsam. Sie werden deshalb nur an Systeme mit einer Intel-CPU verteilt.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_96.exe
* '''Genauigkeit:''' doppelt
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE2]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' ja
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)

[[Kategorie:Folding@Home]]

Portal:Folding@Home/Cores

2008-03-30T08:29:22Z

Affenkopf: /* Gromacs Simulated Tempering */

[[Portal:Folding@Home|Folding@Home]] untersucht ein breites Spektrum an Problemen und verwendet dabei viele verschiedene Verfahren. Aus diesem Grund gibt es bei diesem Projekt mehrere Arten von [[Work-Unit|Work-Units]], die sich untereinander vor allem in den zur Lösung verwendeten Algorithmen unterscheiden. Jeder [[Work-Unit|WU]]-Typ wird von einem eigenen [[Core]] berechnet. Insgesamt gibt es bei Folding@Home derzeit 12 Cores.

== Tinker ==

Der '''Tinker''' Core ist der älteste Core. Er wurde inzwischen durch den moderneren [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Core und seine verschiedenen Derivate abgelöst.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_65.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:''' keine
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (PowerPC)

== Gromacs ==

Der '''Gromacs''' Core hat zusammen mit seinen Derivaten den [[Portal:Folding@Home/Cores#Tinker|Tinker]] Core abgelöst und ist nun der am häufigsten verwendete Core. Er basiert auf der gleichnamigen Anwendung, welche von der University of Groningen unter der GPL-Lizenz entwickelt wird. Er kann die [[SIMD]]-Erweiterungen moderner CPUs nutzen.

Gromacs ist die Abkürzung für '''Gro'''ningen '''Ma'''chine for '''C'''hemical '''S'''imulations.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_78.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE]]
** [[3DNow!]]
** [[AltiVec]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (PowerPC)

== Double Gromacs ==

Der '''Double Gromacs''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Cores, welches doppelte statt einfacher Genauigkeit verwendet.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_79.exe
* '''Genauigkeit:''' doppelt
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE2]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (PowerPC)

== Double Gromacs B ==

Der '''Double Gromacs B''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Double Gromacs|Double Gromacs]] Cores, welches um einige wissenschaftliche Verfahren erweitert wurde.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_7B.exe
* '''Genauigkeit:''' doppelt
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE2]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (PowerPC)

== GBGromacs ==

Der '''GBGromacs''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Cores, welches um das "Generalized Born implicit solvent"-Verfahren erweitert wurde.

GBGromacs ist die Abkürzung für '''G'''eneralized '''B'''orn '''Gromacs'''.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_7A.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach(?)
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:''' ?
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (PowerPC)

== Gromacs 33 ==

Der '''Gromacs 33''' Core ist ein aktualisierter [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Core. Er basiert auf Version 3.3 der Gromacs-Anwendung der University of Groningen.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_A0.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach(?)
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)
** MacOS X (x86)

== Gromacs SREM ==

Der '''Gromacs SREM''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Cores, welches um das "Replica Exchange"-Verfahren erweitert wurde.

SREM ist die Abkürzung für '''S'''erial '''R'''eplica '''E'''xchange '''M'''ethod.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_80.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach(?)
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:''' ?
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)

== Gromacs Simulated Tempering ==

Der '''GROSimT''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Cores, welches um den "Simulated Tempering"-Algorithmus erweitert wurde.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_81.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach(?)
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Linux (x86)
** Windows

== Gromacs SMP ==

Der '''Gromacs SMP''' Core ist ein Derivat des [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Cores, welches für Multiprozessorsysteme ([[SMP]]) angepasst wurde. Der Core benötigt ein System mit mindestens zwei Prozessorkernen. Optimiert wurde er auf 4 Kerne.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_A1.exe, FahCore_A2.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' ja
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86) - nur Version 1.74 (FahCore_A1.exe)
** Linux (x86-64)
** MacOS X (x86)

== GPU Gromacs ==

Der [[GPU]]-Client verwendet einen Core, der im Wesentlichen ein sehr stark veränderter [[Portal:Folding@Home/Cores#Gromacs|Gromacs]] Core ist. Er läuft nicht auf der CPU, sondern nutzt die Shader moderner Grafikchips, welche aufgrund ihrer sehr starken Spezialisierung um ein vielfaches schneller sind als eine CPU.

Derzeit werden nur Grafikchips von ATI/AMD unterstützt. Eine Version für NVIDIA-Chips ist geplant.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_10.exe
* '''Genauigkeit:''' einfach
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' ja (Crossfire)
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
* '''unterstützte Grafikchips:'''
** AMD R520 (X1800)
** AMD RV530 (X1650)
** AMD RV570 (X1650 XT, X1950)
** AMD R580 (X19xx)

== AMBER ==

Der '''AMBER''' Core ist ein Programm zur Berechnung von Moleküldynamiken, welches ursprünglich von der University of California entwickelt wurde und nun vom Scripps Research Institute weiterentwickelt wird.

AMBER ist die Abkürzung für '''A'''ssisted '''M'''odel '''B'''uilding and '''E'''nergy '''R'''efinement.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_82.exe
* '''Genauigkeit:''' doppelt
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:''' keine ([[SSE2]] geplant)
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' nein
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)

== QMD ==

Der '''QMD''' Core nutzt einen quantenchemischen Ansatz und basiert auf dem CPMD-Programm, welches von verschiedenen weltweit verteilten Einrichtungen entwickelt wird. Er ist Multithreading-fähig.

Da der verwendete Intel Fortran Compiler auf AMD-CPUs absichtlich kein [[SSE2]] verwendet und Intel es nicht erlaubt, diese Einschränkung zu umgehen, laufen QMD-WUs auf AMD-Prozessoren sehr langsam. Sie werden deshalb nur an Systeme mit einer Intel-CPU verteilt.

Details:
* '''Dateiname:''' FahCore_96.exe
* '''Genauigkeit:''' doppelt
* '''unterstützte [[SIMD]]-Erweiterungen:'''
** [[SSE2]]
* '''[[SMP]]-Unterstützung:''' ja
* '''unterstützte Plattformen:'''
** Windows (x86)
** Linux (x86)

[[Kategorie:Folding@Home]]