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GPUGRID

2008-09-15T16:43:08Z

JKuehl: /* Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) */ ENTFERNT WEGEN ANSTIEG DER BERECHNUNGSDAUER!

{| {{Steckbrief}}
|-
| {{Steckbrief Kategorie|Chemie}}
|-
| {{Steckbrief Betreiber|Research Unit of Biomedical Informatics, Barcelona Biomedical Research Park}}
|-
| {{Steckbrief Nationalität|Spanien|es}}
|-
| {{Steckbrief Start|Februar 2007}}
|-
| {{Steckbrief Status|?}}
|-
| {{Steckbrief Checkpoints|Ja}}
|-
| {{Steckbrief Webseite|URL=http://www.ps3grid.net|Name=www.ps3grid.net}}
|-
| {{Steckbrief Anmeldung|URL=http://www.ps3grid.net/}}
|-
| {{Steckbrief Clients Systeme}}
|-
| {{Steckbrief Clients Architektur|GPU ([[CUDA]])|Alpha|Beta|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief Clients Architektur|[[Cell]] (PS3)|-|x|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik|URL=http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik Live|Name=PS3GRID}}
|}

'''PS3GRID''' simuliert den Ionen-Transport von [http://de.wikipedia.org/wiki/Gramicidin Gramicidin]-A-Atomen. Unter den [[BOINC]]-Projekten nimmt PS3GRID eine Sonderstellung ein, da für die Berechnungen vordergründig die Spielekonsole Sony Playstation 3 sowie neuere NVIDIA-Grafikkarten eingesetzt werden.

== Projektbeschreibung ==

PS3GRID/GPUGRID stellt eine Supercomputer-Infrastruktur dar, die es Forschern ermöglichst dynamische biomolekulare Prozesse auf der Ebene von Atome zu visualisieren und diese somit besser zu verstehen. Verwendet wird dabei sie sogenannte Full-Atom Molecular Dynamics-Methode. Bei diesen Berechnungen werden die Abstände von mehreren 10.000 Atomen in einem simulierten Protein/Membranfragment zueinander innerhalb von sehr kurzen Zeitabständen berechnet. Üblicherweise liegen die Zeitabstände im Femtosekunden-Bereich (10E minus 15 Sekunden).
Für die Berechnung/Visualisierung von biologisch relevanten Prozessen, wie beispielsweise der Durchgang eines Ions durch einen entsprechenden Ionenkanal in der Membran einer Zelle [http://www.ps3grid.net/img/movie.gif] bedarf es einer enormen Rechenleistung. Die zu visualisierenden biologischen Prozesse laufen Üblicherweise im Bereich von hundertstel-Sekunden bis Millisekunden ab (10E minus 2 bis 10E minus 6). Um diesen Vorgang berechnen/visualisieren zu können, müssen die Abstände aller Atome in der zu untersuchenden "Probe" berechnet werden und dies zu jeder Femtosekunde. Um eine Millisekunde eines dynamischen Prozesses zu berechnen, müssen demnach ~150 Millionen mal alle Abstände aller Atome zueinander berechnet werden. Bei 30.000 Atomen, wie in dem aktuell (Stand September 2008) berechneten Kalium-Kanal GramidicinA, wird deutlich wie rechenintensiv diese Art von Berechnungen sind.

== Erfolge des Projekts ==

Am September 6, 2008 hat das Projekt PS3GRID-GPUGRID die Marke von 1.000.000 Credits pro Tag erreicht.

== Planet 3DNow! ==

Planet 3DNow! nimmt seit dem 18.07.2008 mit einem eigenen Team an PS3GRID teil; die ersten Credits gab es am 15.08.2008. Am 10.09.2008 wurde schließlich der erste Meilenstein von 1.000.000 Credits erreicht. Zu diesem Zeitpunkt waren 22 Teilnehmer im Team aktiv.

== Teilnahme ==

PS3GRID bietet derzeit 2 verschiedene Möglichkeiten der Teilname. Zum Einen natürlich mittels einer Playstation 3, welche dem Projekt auch den Namen verleiht.

Seit dem 17.07. 2008 ist es ebenfalls möglich, mittels einer CUDA-fähigen NVIDIA-Grafikkarte teilzunehmen. Geeignet sind jedoch nur jene mit "compute capabilities" Level 1.1 oder höher. Karten die auf der G80-GPU (Geforce 8800 GTS 320/640, GTX und Ultra) basieren können nicht am Projekt teilnehmen, sie unterstützen nur das "compute capability" Level 1.0.
Die Betreiber empfehlen weiterhin Karten mit mindestens 50 Streamprozessoren (Shadern).

Derzeit (September 2008) wären das demnach:

'''NVIDIA-Geforce-8-Serie:'''
96 Shader: Geforce 8800 GS
112 Shader: Geforce 8800 GT
128 Shader: Geforce 8800 GTS 512/1024 MiB

'''NVIDIA-Geforce-9-Serie:'''
64 Shader: Geforce 9600 GT
96 Shader: Geforce 9600 GSO
112 Shader: Geforce 9800 GT
128 Shader: Geforce 9800 GTX, Geforce 9800 GTX+
2x128 Shader: Geforce 9800 GX2

'''NVIDIA-Geforce-200-Serie''':
192 Shader: Geforce GTX 260
240 Shader: Geforce GTX 280

Auf Karten mit weniger Streamprozessoren läuft das Projekt ebenfalls, allerdings können die Berechnungszeiten dann die 4 Tage betragende Deadline überschreiten.

Weiterhin notwendig ist ein [http://www.nvidia.com/object/cuda_get.html CUDA-fähiger Treiber] von NVIDIA sowie ein BOINC-Client mit einer Versionsnummer ab [http://boinc.berkeley.edu/dl/?C=M;O=D 6.3.10]. Empfohlen werden für Treiber und BOINC-Client jeweils die aktuellsten Versionen.

Grafiktreiber und BOINC-Client werden nun installiert, das Vorgehen kann je nach Betriebssystem bzw. Distribution variieren.
Unter Linux gilt es zu beachten, dass der Benutzer, der BOINC startet, auch Mitglied der Gruppe ''video'' sein muss. Heißt der Benutzer etwa ''boinc'', ist dieses mit dem Befehl ''usermod -G video boinc'' umgehend erledigt. Ist der Benutzer nicht Mitglied dieser Gruppe, wird die Grafikkarte nicht als Coprozessor erkannt.

Für Windows ist noch anzumerken, dass bei der Installation von BOINC der getrennte Speicherbereich deaktiviert werden muss, da sonst BOINC beim Start diese Meldung anzeigt, und somit die WUs mit einem Berechnungsfehler abbrechen:

26.08.2008 10:58:57 [---] CUDA devices found
26.08.2008 10:58:57 [---] Coprocessor:''' Device Emulation (CPU)''' (1)

'''''Achtung:''''' Da der getrennte Speicherbereich nachträglich nicht deaktiviert werden kann, muss der BOINC-Client neu installiert werden. Siehe dazu auch [[Portal:BOINC/Installation/Windows#Installation_des_Clients_(ab_Version_6.x.x)|Installation des BOINC-Clients 6.x.x]]

Wenn alles richtig eingerichtet ist, zeigt BOINC nun bei jedem Start eine Nachricht wie die folgende an:

14-Aug-2008 19:04:53 [---] CUDA devices found
14-Aug-2008 19:04:53 [---] Coprocessor: '''GeForce 9800 GT''' (1)

Nun kann der Computer über die Anmeldeadresse [http://www.ps3grid.net/ http://www.ps3grid.net/] dem Projekt beitreten. Daraufhin erhält er pro GPU-Kern jeweils eine Work-Unit.

=== Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) ===

Seit der Version 6.45 (Windows) bzw. 6.44 (Linux) wird von PS3GRID ''kein'' kompletter CPU-Kern mehr beansprucht. Jedoch sieht BOINC den Kern derzeit weiter als belegt an und weist ihm keine [[Work-Unit|WU]] eines anderen Projekts zu. Durch Verwendung eines Flags in der Datei ''cc_config.xml'' kann man dieses Problem lösen und z. B. bei einem Quad-Core "5" Kerne rechnen lassen, d. h. 4x CPU, 1x GPU.

Allerdings bricht damit die Berechnungsdauer der WU gnadenlos ein, so z.B. auf einer GTX260 von rund 31.000 Sekunden auf 56.000 Sekunden.''' Es wird empfohlen das ncpus flag NICHT zu verwenden und auf die offizielle Boincmanager-Version zu warten. Daher wurde der Hinweis hier entfernt.'''

== Rechenzeiten ==

Die Rechenzeiten mit dem neuen Windows-Client 6.45 scheinen im Gegensatz zur Version 6.43 stark erhöht zu sein. Dafür sinkt die CPU-Last von einem vollen Kern auf nahezu 0 (wenige Sekunden pro WU). Grund für die Erhöhung könnten andere Parameter und genauere Berechnungen sein.

{| class="dcw_fullWidthTable"
! class="dcw_normalTableCell" | '''Kartenbezeichnung'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Chiptakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Shadertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Speichertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''OS'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Treiber'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''PS3GRID App'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Rechenzeit'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Zeit pro Schritt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Benutzer'''
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce GTX 280
! class="dcw_normalTableCell" | 684Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1458Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1296Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 25150s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5503 indiana@seti]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1484Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 29576s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=3961 JKuehl]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Sparkle Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1750Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 31734s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_host_detail.php?hostid=7652 FeuerKater]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Colorful GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.450Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 32705s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5877 HGW]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 796Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1976hz
! class="dcw_normalTableCell" | 1137Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 33567s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5402 woever]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte 9800GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 740Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1836Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1100Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit HomePre.
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36550s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=6077 JagDoc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Leadtek Geforce 8800 GTS 512 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 725 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36700s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 8800 GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 750MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1806MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.35
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36761s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5615 Pjack]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | PNY Geforce 8800 GT 256 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 650 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1800 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32 bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 43400s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 729MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 44800s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/results.php?hostid=8437 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce 8800GTS
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 972Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 46000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 730MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 53,181ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 49000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1512MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 69,402 ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | inno3D Geforce 9600 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP3 32-Bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.84
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 86191s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5858 Nero24]
|}

== Banner ==

[[Bild:Banner PS3GRID.jpg]]

== Weblinks ==

* [http://www.ps3grid.net www.ps3grid.net] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598 Planet 3DNow! Teamstatistik]

{{NaviBlock
|Vorlage:Navigationsleiste BOINC
|Navigationsleiste Nicht-BOINC
}}

[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]

GPUGRID

2008-09-14T23:06:45Z

JKuehl: /* Teilnahme */

{| {{Steckbrief}}
|-
| {{Steckbrief Kategorie|Chemie}}
|-
| {{Steckbrief Betreiber|Research Unit of Biomedical Informatics, Barcelona Biomedical Research Park}}
|-
| {{Steckbrief Nationalität|Spanien|es}}
|-
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|-
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|-
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|-
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|-
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| {{Steckbrief P3D-Statistik Live|Name=PS3GRID}}
|}

'''PS3GRID''' simuliert den Ionen-Transport von [http://de.wikipedia.org/wiki/Gramicidin Gramicidin]-A-Atomen. Unter den [[BOINC]]-Projekten nimmt PS3GRID eine Sonderstellung ein, da für die Berechnungen vordergründig die Spielekonsole Sony Playstation 3 sowie neuere NVIDIA-Grafikkarten eingesetzt werden.

== Projektbeschreibung ==

PS3GRID/GPUGRID stellt eine Supercomputer-Infrastruktur dar, die es Forschern ermöglichst dynamische biomolekulare Prozesse auf der Ebene von Atome zu visualisieren und diese somit besser zu verstehen. Verwendet wird dabei sie sogenannte Full-Atom Molecular Dynamics-Methode. Bei diesen Berechnungen werden die Abstände von mehreren 10.000 Atomen in einem simulierten Protein/Membranfragment zueinander innerhalb von sehr kurzen Zeitabständen berechnet. Üblicherweise liegen die Zeitabstände im Femtosekunden-Bereich (10E minus 15 Sekunden).
Für die Berechnung/Visualisierung von biologisch relevanten Prozessen, wie beispielsweise der Durchgang eines Ions durch einen entsprechenden Ionenkanal in der Membran einer Zelle [http://www.ps3grid.net/img/movie.gif] bedarf es einer enormen Rechenleistung. Die zu visualisierenden biologischen Prozesse laufen Üblicherweise im Bereich von hundertstel-Sekunden bis Millisekunden ab (10E minus 2 bis 10E minus 6). Um diesen Vorgang berechnen/visualisieren zu können, müssen die Abstände aller Atome in der zu untersuchenden "Probe" berechnet werden und dies zu jeder Femtosekunde. Um eine Millisekunde eines dynamischen Prozesses zu berechnen, müssen demnach ~150 Millionen mal alle Abstände aller Atome zueinander berechnet werden. Bei 30.000 Atomen, wie in dem aktuell (Stand September 2008) berechneten Kalium-Kanal GramidicinA, wird deutlich wie rechenintensiv diese Art von Berechnungen sind.

== Erfolge des Projekts ==

Am September 6, 2008 hat das Projekt PS3GRID-GPUGRID die Marke von 1.000.000 Credits pro Tag erreicht.

== Planet 3DNow! ==

Planet 3DNow! nimmt seit dem 18.07.2008 mit einem eigenen Team an PS3GRID teil; die ersten Credits gab es am 15.08.2008.

Am 10.09.2008 erreichte der grüne Planet seine ersten 1.000.000 Credits, 22 Active members waren gemeldet.

== Teilnahme ==

PS3GRID bietet derzeit 2 verschiedene Möglichkeiten der Teilname. Zum Einen natürlich mittels einer Playstation 3, welche dem Projekt auch den Namen verleiht.

Seit dem 17.07. 2008 ist es ebenfalls möglich, mittels einer CUDA-fähigen NVIDIA-Grafikkarte teilzunehmen. Geeignet sind jedoch nur jene mit "compute capabilities" Level 1.1 oder höher. Karten die auf der G80-GPU (Geforce 8800 GTS 320/640, GTX und Ultra) basieren können nicht am Projekt teilnehmen, sie unterstützen nur das "compute capability" Level 1.0.
Die Betreiber empfehlen weiterhin Karten mit mindestens 50 Streamprozessoren (Shadern).

Derzeit (September 2008) wären das demnach:

'''NVIDIA-Geforce-8-Serie:'''
96 Shader: Geforce 8800 GS
112 Shader: Geforce 8800 GT
128 Shader: Geforce 8800 GTS 512/1024 MiB

'''NVIDIA-Geforce-9-Serie:'''
64 Shader: Geforce 9600 GT
96 Shader: Geforce 9600 GSO
112 Shader: Geforce 9800 GT
128 Shader: Geforce 9800 GTX, Geforce 9800 GTX+
2x128 Shader: Geforce 9800 GX2

'''NVIDIA-Geforce-200-Serie''':
192 Shader: Geforce GTX 260
240 Shader: Geforce GTX 280

Auf Karten mit weniger Streamprozessoren läuft das Projekt ebenfalls, allerdings können die Berechnungszeiten dann die 4 Tage betragende Deadline überschreiten.

Weiterhin notwendig ist ein [http://www.nvidia.com/object/cuda_get.html CUDA-fähiger Treiber] von NVIDIA sowie ein BOINC-Client mit einer Versionsnummer ab [http://boinc.berkeley.edu/dl/?C=M;O=D 6.3.10.] . Empfohlen werden für Treiber und BOINC-Client jeweils die aktuellsten Versionen.

'''''Update :''''' seit dem 12.09.2008 wird für die Gridberechnung ''kein'' kompletter Kern mehr beansprucht! (Linux Version 6.44, Windows Version 6.45). Bis zum Erscheinen des neuen Clients gibt es auf dieser Seite weiter unten einen Workaround, der es erlaubt, gleichzeitig alle Kerne der CPU und die der Grafikkarten zu nutzen.

Grafiktreiber und BOINC-Client werden nun installiert, das Vorgehen kann je nach Betriebssystem bzw. Distribution variieren.
Unter Linux gilt es zu beachten, dass der Benutzer, der BOINC startet, auch Mitglied der Gruppe ''video'' sein muss. Heißt der Benutzer etwa ''boinc'', ist dieses mit dem Befehl ''usermod -G video boinc'' umgehend erledigt. Ist der Benutzer nicht Mitglied dieser Gruppe, wird die Grafikkarte nicht als Coprozessor erkannt.

Für Windows ist noch anzumerken, dass bei der Installation von BOINC der getrennte Speicherbereich deaktiviert werden muss, da sonst BOINC beim Start diese Meldung anzeigt, und somit die WUs mit einem Berechnungsfehler abbrechen:

26.08.2008 10:58:57 [---] CUDA devices found
26.08.2008 10:58:57 [---] Coprocessor:''' Device Emulation (CPU)''' (1)

'''''Achtung:''''' Da der getrennte Speicherbereich nachträglich nicht deaktiviert werden kann, muss der BOINC-Client neu installiert werden. Siehe dazu auch [[Portal:BOINC/Installation/Windows#Installation_des_Clients_(ab_Version_6.x.x)|Installation des BOINC-Clients 6.x.x]]

Wenn alles richtig eingerichtet ist, zeigt BOINC nun bei jedem Start eine Nachricht wie die folgende an:

14-Aug-2008 19:04:53 [---] CUDA devices found
14-Aug-2008 19:04:53 [---] Coprocessor: '''GeForce 9800 GT''' (1)

Nun kann der Computer über die Anmeldeadresse [http://www.ps3grid.net/ http://www.ps3grid.net/] dem Projekt beitreten. Daraufhin erhält er pro und GPU-Kern jeweils eine [[Work-Unit]].

== Rechenzeiten ==

Die Rechenzeiten mit dem neuen Windows Client 6.45 scheinen im Gegensatz zu 6.43 stark erhöht zu sein (genauere Werte folgen in den nächsten Tagen). Dafür sinkt die CPU-Last von einem vollen Kern auf nahezu 0 (wenige Sekunden pro WU). Grund für die Erhöhung könnten andere Parameter und genauere Berechnungen sein.

{| class="dcw_fullWidthTable"
! class="dcw_normalTableCell" | '''Kartenbezeichnung'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Chiptakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Shadertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Speichertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''OS'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Treiber'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''PS3GRID App'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Rechenzeit'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Zeit pro Schritt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Benutzer'''
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce GTX 280
! class="dcw_normalTableCell" | 684Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1458Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1296Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 25150s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5503 indiana@seti]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1484Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
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! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=3961 JKuehl]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Sparkle Geforce 8800GT
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! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_host_detail.php?hostid=7652 FeuerKater]
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! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5877 HGW]
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! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GTX+
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! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte 9800GTX+
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! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
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! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 8800 GTS 512
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! class="dcw_normalTableCell" | 1000MHz
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! class="dcw_normalTableCell" | PNY Geforce 8800 GT 256 MB
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! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
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! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 729MHz
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! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
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! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/results.php?hostid=8437 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce 8800GTS
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 972Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 46000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 730MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 53,181ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 49000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1512MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 69,402 ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | inno3D Geforce 9600 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP3 32-Bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.84
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 86191s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5858 Nero24]
|}

== Banner ==

[[Bild:Banner PS3GRID.jpg]]

== Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) ==
folgende Änderung ist notwendig, bis ein angepasster Boinc-Client herausgebracht wird.

Durch Verwendung eines Flags in der cc_config.xml kann man z.B. bei einem Quad Core "5" Kerne crunchen lassen. Sprich 4x CPU 1x GPU. (Sonst nur 3x CPU 1x GPU möglich).

Zuerst den Boincmanager / Boinc komplett schließen.

Falls die Datei''' cc_config.xml''' nicht in eurem boinc-ordner (Datenordner, bei den neueren Boincs ist dieser getrennt vom Programmordner, meist unter Anwendungsdaten zu finden'. Falls die Datei nicht existiert, einfach anlegen (einfache Textdatei z.B. mit Notepad, Editor, Wordpad).

Unter Vista64 muss die Datei hier angelegt werden: C:\ProgramData\BOINC
Unter XP muss die Datei hier angelegt werden: ''[BITTE JEMAND DEN PFAD EINFÜGEN!]''

Der Ordner ist versteckt muss also sichtbar gemacht werden, oder in der Explorersuche in den erweiterten Suchfunktionen angeben , dass Systemordner und versteckte Dateien mit durchsucht werden müssen

----
<cc_config>

<options>

<ncpus>8</ncpus>

</options>

</cc_config>

----

Danach den Boincmanager / Boinc neu starten. Man sollte nun unter Meldungen die Meldung "Reading preferences override file" sehen und unter "Aufgaben" dass alle Kerne rechnen.

'''Angenehmer Nebeneffekt: Bunkererhöhung'''
Alle Projekte die nur einen Bunker von X WUs/Core zulassen, ziehen sich auch entsprechend mehr. Ich habe z.B. auf 8 Cores erhöht, jetzt laufen 7 Instanzen Spinhenge und eine Ps3Grid. (Frisst natürlich auch mehr RAM und ggf. wird auch die Berechnung verlangsamt weil die CPU / der Speicher zu viel zu tun hat). PS3Grid bunkert z.B. nun auch 8 statt 4 WUs

== Weblinks ==

* [http://www.ps3grid.net www.ps3grid.net] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598 Planet 3DNow! Teamstatistik]

{{NaviBlock
|Vorlage:Navigationsleiste BOINC
|Navigationsleiste Nicht-BOINC
}}

[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]

GPUGRID

2008-09-14T23:01:11Z

JKuehl: /* Rechenzeiten */

{| {{Steckbrief}}
|-
| {{Steckbrief Kategorie|Chemie}}
|-
| {{Steckbrief Betreiber|Research Unit of Biomedical Informatics, Barcelona Biomedical Research Park}}
|-
| {{Steckbrief Nationalität|Spanien|es}}
|-
| {{Steckbrief Start|Februar 2007}}
|-
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|-
| {{Steckbrief Checkpoints|Ja}}
|-
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|-
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|-
| {{Steckbrief Clients Systeme}}
|-
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|-
| {{Steckbrief Clients Architektur|[[Cell]] (PS3)|-|x|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik|URL=http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik Live|Name=PS3GRID}}
|}

'''PS3GRID''' simuliert den Ionen-Transport von [http://de.wikipedia.org/wiki/Gramicidin Gramicidin]-A-Atomen. Unter den [[BOINC]]-Projekten nimmt PS3GRID eine Sonderstellung ein, da für die Berechnungen vordergründig die Spielekonsole Sony Playstation 3 sowie neuere NVIDIA-Grafikkarten eingesetzt werden.

== Projektbeschreibung ==

PS3GRID/GPUGRID stellt eine Supercomputer-Infrastruktur dar, die es Forschern ermöglichst dynamische biomolekulare Prozesse auf der Ebene von Atome zu visualisieren und diese somit besser zu verstehen. Verwendet wird dabei sie sogenannte Full-Atom Molecular Dynamics-Methode. Bei diesen Berechnungen werden die Abstände von mehreren 10.000 Atomen in einem simulierten Protein/Membranfragment zueinander innerhalb von sehr kurzen Zeitabständen berechnet. Üblicherweise liegen die Zeitabstände im Femtosekunden-Bereich (10E minus 15 Sekunden).
Für die Berechnung/Visualisierung von biologisch relevanten Prozessen, wie beispielsweise der Durchgang eines Ions durch einen entsprechenden Ionenkanal in der Membran einer Zelle [http://www.ps3grid.net/img/movie.gif] bedarf es einer enormen Rechenleistung. Die zu visualisierenden biologischen Prozesse laufen Üblicherweise im Bereich von hundertstel-Sekunden bis Millisekunden ab (10E minus 2 bis 10E minus 6). Um diesen Vorgang berechnen/visualisieren zu können, müssen die Abstände aller Atome in der zu untersuchenden "Probe" berechnet werden und dies zu jeder Femtosekunde. Um eine Millisekunde eines dynamischen Prozesses zu berechnen, müssen demnach ~150 Millionen mal alle Abstände aller Atome zueinander berechnet werden. Bei 30.000 Atomen, wie in dem aktuell (Stand September 2008) berechneten Kalium-Kanal GramidicinA, wird deutlich wie rechenintensiv diese Art von Berechnungen sind.

== Erfolge des Projekts ==

Am September 6, 2008 hat das Projekt PS3GRID-GPUGRID die Marke von 1.000.000 Credits pro Tag erreicht.

== Planet 3DNow! ==

Planet 3DNow! nimmt seit dem 18.07.2008 mit einem eigenen Team an PS3GRID teil; die ersten Credits gab es am 15.08.2008.

Am 10.09.2008 erreichte der grüne Planet seine ersten 1.000.000 Credits, 22 Active members waren gemeldet.

== Teilnahme ==

PS3GRID bietet derzeit 2 verschiedene Möglichkeiten der Teilname. Zum Einen natürlich mittels einer Playstation 3, welche dem Projekt auch den Namen verleiht.

Seit dem 17.07. 2008 ist es ebenfalls möglich, mittels einer CUDA-fähigen NVIDIA-Grafikkarte teilzunehmen. Geeignet sind jedoch nur jene mit "compute capabilities" Level 1.1 oder höher. Karten die auf der G80-GPU (Geforce 8800 GTS 320/640, GTX und Ultra) basieren können nicht am Projekt teilnehmen, sie unterstützen nur das "compute capability" Level 1.0.
Die Betreiber empfehlen weiterhin Karten mit mindestens 50 Streamprozessoren (Shadern).

Derzeit (September 2008) wären das demnach:

'''NVIDIA-Geforce-8-Serie:'''
96 Shader: Geforce 8800 GS
112 Shader: Geforce 8800 GT
128 Shader: Geforce 8800 GTS 512/1024 MiB

'''NVIDIA-Geforce-9-Serie:'''
64 Shader: Geforce 9600 GT
96 Shader: Geforce 9600 GSO
112 Shader: Geforce 9800 GT
128 Shader: Geforce 9800 GTX, Geforce 9800 GTX+
2x128 Shader: Geforce 9800 GX2

'''NVIDIA-Geforce-200-Serie''':
192 Shader: Geforce GTX 260
240 Shader: Geforce GTX 280

Auf Karten mit weniger Streamprozessoren läuft das Projekt ebenfalls, allerdings können die Berechnungszeiten dann die 4 Tage betragende Deadline überschreiten.

Weiterhin notwendig ist ein [http://www.nvidia.com/object/cuda_get.html CUDA-fähiger Treiber] von NVIDIA sowie ein BOINC-Client mit einer Versionsnummer ab [http://boinc.berkeley.edu/dl/?C=M;O=D 6.3.10.] . Empfohlen werden für Treiber und BOINC-Client jeweils die aktuellsten Versionen.

'''''Update :''''' seit dem 12.09.2008 wird für die Gridberechnung unter Linux ''kein'' kompletter Kern mehr beansprucht! Windows User müssen noch warten bis der 6.3.11´er Boinc Manager da ist.

Grafiktreiber und BOINC-Client werden nun installiert, das Vorgehen kann je nach Betriebssystem bzw. Distribution variieren.
Unter Linux gilt es zu beachten, dass der Benutzer, der BOINC startet, auch Mitglied der Gruppe ''video'' sein muss. Heißt der Benutzer etwa ''boinc'', ist dieses mit dem Befehl ''usermod -G video boinc'' umgehend erledigt. Ist der Benutzer nicht Mitglied dieser Gruppe, wird die Grafikkarte nicht als Coprozessor erkannt.

Für Windows ist noch anzumerken, dass bei der Installation von BOINC der getrennte Speicherbereich deaktiviert werden muss, da sonst BOINC beim Start diese Meldung anzeigt:

26.08.2008 10:58:57 [---] CUDA devices found
26.08.2008 10:58:57 [---] Coprocessor: Device Emulation (CPU) (1)

'''''Achtung:''''' Da der getrennte Speicherbereich nachträglich nicht deaktiviert werden kann, muss der BOINC-Client neu installiert werden. Siehe dazu auch [[Portal:BOINC/Installation/Windows#Installation_des_Clients_(ab_Version_6.x.x)|Installation des BOINC-Clients 6.x.x]]

Wenn alles richtig eingerichtet ist, zeigt BOINC nun bei jedem Start eine Nachricht wie die folgende an:

14-Aug-2008 19:04:53 [---] CUDA devices found
14-Aug-2008 19:04:53 [---] Coprocessor: GeForce 9800 GT (1)

Nun kann der Computer über die Anmeldeadresse [http://www.ps3grid.net/ http://www.ps3grid.net/] dem Projekt beitreten. Daraufhin erhält er pro und GPU-Kern jeweils eine [[Work-Unit]]. Aktuell wird jeweils 1 CPU-Kern zusätzlich zum GPU-Kern belegt. Laut Betreiberauskunft wird das in zukünftigen Programmversion nicht mehr der Fall sein. Der zusätzlich von der PS3GRID-Applikation belegte CPU-Kern arbeitet dann wieder unabhängig vom GPU-Kern und kann somit für weitere BOINC-Projekte rechnen.

== Rechenzeiten ==

Die Rechenzeiten mit dem neuen Windows Client 6.45 scheinen im Gegensatz zu 6.43 stark erhöht zu sein (genauere Werte folgen in den nächsten Tagen). Dafür sinkt die CPU-Last von einem vollen Kern auf nahezu 0 (wenige Sekunden pro WU). Grund für die Erhöhung könnten andere Parameter und genauere Berechnungen sein.

{| class="dcw_fullWidthTable"
! class="dcw_normalTableCell" | '''Kartenbezeichnung'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Chiptakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Shadertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Speichertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''OS'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Treiber'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''PS3GRID App'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Rechenzeit'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Zeit pro Schritt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Benutzer'''
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce GTX 280
! class="dcw_normalTableCell" | 684Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1458Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1296Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 25150s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5503 indiana@seti]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1484Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 29576s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=3961 JKuehl]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Sparkle Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1750Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 31734s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_host_detail.php?hostid=7652 FeuerKater]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Colorful GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.450Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 32705s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5877 HGW]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 796Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1976hz
! class="dcw_normalTableCell" | 1137Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 33567s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5402 woever]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte 9800GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 740Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1836Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1100Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit HomePre.
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36550s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=6077 JagDoc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Leadtek Geforce 8800 GTS 512 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 725 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36700s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 8800 GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 750MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1806MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.35
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36761s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5615 Pjack]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | PNY Geforce 8800 GT 256 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 650 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1800 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32 bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 43400s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 729MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 44800s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/results.php?hostid=8437 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce 8800GTS
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 972Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 46000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 730MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 53,181ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 49000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1512MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 69,402 ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | inno3D Geforce 9600 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP3 32-Bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.84
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 86191s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5858 Nero24]
|}

== Banner ==

[[Bild:Banner PS3GRID.jpg]]

== Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) ==
folgende Änderung ist notwendig, bis ein angepasster Boinc-Client herausgebracht wird.

Durch Verwendung eines Flags in der cc_config.xml kann man z.B. bei einem Quad Core "5" Kerne crunchen lassen. Sprich 4x CPU 1x GPU. (Sonst nur 3x CPU 1x GPU möglich).

Zuerst den Boincmanager / Boinc komplett schließen.

Falls die Datei''' cc_config.xml''' nicht in eurem boinc-ordner (Datenordner, bei den neueren Boincs ist dieser getrennt vom Programmordner, meist unter Anwendungsdaten zu finden'. Falls die Datei nicht existiert, einfach anlegen (einfache Textdatei z.B. mit Notepad, Editor, Wordpad).

Unter Vista64 muss die Datei hier angelegt werden: C:\ProgramData\BOINC
Unter XP muss die Datei hier angelegt werden: ''[BITTE JEMAND DEN PFAD EINFÜGEN!]''

Der Ordner ist versteckt muss also sichtbar gemacht werden, oder in der Explorersuche in den erweiterten Suchfunktionen angeben , dass Systemordner und versteckte Dateien mit durchsucht werden müssen

----
<cc_config>

<options>

<ncpus>8</ncpus>

</options>

</cc_config>

----

Danach den Boincmanager / Boinc neu starten. Man sollte nun unter Meldungen die Meldung "Reading preferences override file" sehen und unter "Aufgaben" dass alle Kerne rechnen.

'''Angenehmer Nebeneffekt: Bunkererhöhung'''
Alle Projekte die nur einen Bunker von X WUs/Core zulassen, ziehen sich auch entsprechend mehr. Ich habe z.B. auf 8 Cores erhöht, jetzt laufen 7 Instanzen Spinhenge und eine Ps3Grid. (Frisst natürlich auch mehr RAM und ggf. wird auch die Berechnung verlangsamt weil die CPU / der Speicher zu viel zu tun hat). PS3Grid bunkert z.B. nun auch 8 statt 4 WUs

== Weblinks ==

* [http://www.ps3grid.net www.ps3grid.net] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598 Planet 3DNow! Teamstatistik]

{{NaviBlock
|Vorlage:Navigationsleiste BOINC
|Navigationsleiste Nicht-BOINC
}}

[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]

GPUGRID

2008-09-14T22:59:38Z

JKuehl: /* Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) */

{| {{Steckbrief}}
|-
| {{Steckbrief Kategorie|Chemie}}
|-
| {{Steckbrief Betreiber|Research Unit of Biomedical Informatics, Barcelona Biomedical Research Park}}
|-
| {{Steckbrief Nationalität|Spanien|es}}
|-
| {{Steckbrief Start|Februar 2007}}
|-
| {{Steckbrief Status|?}}
|-
| {{Steckbrief Checkpoints|Ja}}
|-
| {{Steckbrief Webseite|URL=http://www.ps3grid.net|Name=www.ps3grid.net}}
|-
| {{Steckbrief Anmeldung|URL=http://www.ps3grid.net/}}
|-
| {{Steckbrief Clients Systeme}}
|-
| {{Steckbrief Clients Architektur|GPU ([[CUDA]])|Alpha|Beta|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief Clients Architektur|[[Cell]] (PS3)|-|x|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik|URL=http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik Live|Name=PS3GRID}}
|}

'''PS3GRID''' simuliert den Ionen-Transport von [http://de.wikipedia.org/wiki/Gramicidin Gramicidin]-A-Atomen. Unter den [[BOINC]]-Projekten nimmt PS3GRID eine Sonderstellung ein, da für die Berechnungen vordergründig die Spielekonsole Sony Playstation 3 sowie neuere NVIDIA-Grafikkarten eingesetzt werden.

== Projektbeschreibung ==

PS3GRID/GPUGRID stellt eine Supercomputer-Infrastruktur dar, die es Forschern ermöglichst dynamische biomolekulare Prozesse auf der Ebene von Atome zu visualisieren und diese somit besser zu verstehen. Verwendet wird dabei sie sogenannte Full-Atom Molecular Dynamics-Methode. Bei diesen Berechnungen werden die Abstände von mehreren 10.000 Atomen in einem simulierten Protein/Membranfragment zueinander innerhalb von sehr kurzen Zeitabständen berechnet. Üblicherweise liegen die Zeitabstände im Femtosekunden-Bereich (10E minus 15 Sekunden).
Für die Berechnung/Visualisierung von biologisch relevanten Prozessen, wie beispielsweise der Durchgang eines Ions durch einen entsprechenden Ionenkanal in der Membran einer Zelle [http://www.ps3grid.net/img/movie.gif] bedarf es einer enormen Rechenleistung. Die zu visualisierenden biologischen Prozesse laufen Üblicherweise im Bereich von hundertstel-Sekunden bis Millisekunden ab (10E minus 2 bis 10E minus 6). Um diesen Vorgang berechnen/visualisieren zu können, müssen die Abstände aller Atome in der zu untersuchenden "Probe" berechnet werden und dies zu jeder Femtosekunde. Um eine Millisekunde eines dynamischen Prozesses zu berechnen, müssen demnach ~150 Millionen mal alle Abstände aller Atome zueinander berechnet werden. Bei 30.000 Atomen, wie in dem aktuell (Stand September 2008) berechneten Kalium-Kanal GramidicinA, wird deutlich wie rechenintensiv diese Art von Berechnungen sind.

== Erfolge des Projekts ==

Am September 6, 2008 hat das Projekt PS3GRID-GPUGRID die Marke von 1.000.000 Credits pro Tag erreicht.

== Planet 3DNow! ==

Planet 3DNow! nimmt seit dem 18.07.2008 mit einem eigenen Team an PS3GRID teil; die ersten Credits gab es am 15.08.2008.

Am 10.09.2008 erreichte der grüne Planet seine ersten 1.000.000 Credits, 22 Active members waren gemeldet.

== Teilnahme ==

PS3GRID bietet derzeit 2 verschiedene Möglichkeiten der Teilname. Zum Einen natürlich mittels einer Playstation 3, welche dem Projekt auch den Namen verleiht.

Seit dem 17.07. 2008 ist es ebenfalls möglich, mittels einer CUDA-fähigen NVIDIA-Grafikkarte teilzunehmen. Geeignet sind jedoch nur jene mit "compute capabilities" Level 1.1 oder höher. Karten die auf der G80-GPU (Geforce 8800 GTS 320/640, GTX und Ultra) basieren können nicht am Projekt teilnehmen, sie unterstützen nur das "compute capability" Level 1.0.
Die Betreiber empfehlen weiterhin Karten mit mindestens 50 Streamprozessoren (Shadern).

Derzeit (September 2008) wären das demnach:

'''NVIDIA-Geforce-8-Serie:'''
96 Shader: Geforce 8800 GS
112 Shader: Geforce 8800 GT
128 Shader: Geforce 8800 GTS 512/1024 MiB

'''NVIDIA-Geforce-9-Serie:'''
64 Shader: Geforce 9600 GT
96 Shader: Geforce 9600 GSO
112 Shader: Geforce 9800 GT
128 Shader: Geforce 9800 GTX, Geforce 9800 GTX+
2x128 Shader: Geforce 9800 GX2

'''NVIDIA-Geforce-200-Serie''':
192 Shader: Geforce GTX 260
240 Shader: Geforce GTX 280

Auf Karten mit weniger Streamprozessoren läuft das Projekt ebenfalls, allerdings können die Berechnungszeiten dann die 4 Tage betragende Deadline überschreiten.

Weiterhin notwendig ist ein [http://www.nvidia.com/object/cuda_get.html CUDA-fähiger Treiber] von NVIDIA sowie ein BOINC-Client mit einer Versionsnummer ab [http://boinc.berkeley.edu/dl/?C=M;O=D 6.3.10.] . Empfohlen werden für Treiber und BOINC-Client jeweils die aktuellsten Versionen.

'''''Update :''''' seit dem 12.09.2008 wird für die Gridberechnung unter Linux ''kein'' kompletter Kern mehr beansprucht! Windows User müssen noch warten bis der 6.3.11´er Boinc Manager da ist.

Grafiktreiber und BOINC-Client werden nun installiert, das Vorgehen kann je nach Betriebssystem bzw. Distribution variieren.
Unter Linux gilt es zu beachten, dass der Benutzer, der BOINC startet, auch Mitglied der Gruppe ''video'' sein muss. Heißt der Benutzer etwa ''boinc'', ist dieses mit dem Befehl ''usermod -G video boinc'' umgehend erledigt. Ist der Benutzer nicht Mitglied dieser Gruppe, wird die Grafikkarte nicht als Coprozessor erkannt.

Für Windows ist noch anzumerken, dass bei der Installation von BOINC der getrennte Speicherbereich deaktiviert werden muss, da sonst BOINC beim Start diese Meldung anzeigt:

26.08.2008 10:58:57 [---] CUDA devices found
26.08.2008 10:58:57 [---] Coprocessor: Device Emulation (CPU) (1)

'''''Achtung:''''' Da der getrennte Speicherbereich nachträglich nicht deaktiviert werden kann, muss der BOINC-Client neu installiert werden. Siehe dazu auch [[Portal:BOINC/Installation/Windows#Installation_des_Clients_(ab_Version_6.x.x)|Installation des BOINC-Clients 6.x.x]]

Wenn alles richtig eingerichtet ist, zeigt BOINC nun bei jedem Start eine Nachricht wie die folgende an:

14-Aug-2008 19:04:53 [---] CUDA devices found
14-Aug-2008 19:04:53 [---] Coprocessor: GeForce 9800 GT (1)

Nun kann der Computer über die Anmeldeadresse [http://www.ps3grid.net/ http://www.ps3grid.net/] dem Projekt beitreten. Daraufhin erhält er pro und GPU-Kern jeweils eine [[Work-Unit]]. Aktuell wird jeweils 1 CPU-Kern zusätzlich zum GPU-Kern belegt. Laut Betreiberauskunft wird das in zukünftigen Programmversion nicht mehr der Fall sein. Der zusätzlich von der PS3GRID-Applikation belegte CPU-Kern arbeitet dann wieder unabhängig vom GPU-Kern und kann somit für weitere BOINC-Projekte rechnen.

== Rechenzeiten ==

{| class="dcw_fullWidthTable"
! class="dcw_normalTableCell" | '''Kartenbezeichnung'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Chiptakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Shadertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Speichertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''OS'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Treiber'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''PS3GRID App'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Rechenzeit'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Zeit pro Schritt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Benutzer'''
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce GTX 280
! class="dcw_normalTableCell" | 684Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1458Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1296Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 25150s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5503 indiana@seti]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1484Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 29576s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=3961 JKuehl]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Sparkle Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1750Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 31734s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_host_detail.php?hostid=7652 FeuerKater]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Colorful GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.450Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 32705s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5877 HGW]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 796Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1976hz
! class="dcw_normalTableCell" | 1137Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 33567s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5402 woever]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte 9800GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 740Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1836Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1100Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit HomePre.
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36550s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=6077 JagDoc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Leadtek Geforce 8800 GTS 512 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 725 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36700s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 8800 GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 750MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1806MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.35
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36761s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5615 Pjack]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | PNY Geforce 8800 GT 256 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 650 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1800 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32 bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 43400s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 729MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 44800s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/results.php?hostid=8437 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce 8800GTS
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 972Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 46000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 730MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 53,181ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 49000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GT
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! class="dcw_normalTableCell" | 1512MHz
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! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
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! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 69,402 ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | inno3D Geforce 9600 GT
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! class="dcw_normalTableCell" | XP SP3 32-Bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.84
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 86191s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5858 Nero24]
|}

== Banner ==

[[Bild:Banner PS3GRID.jpg]]

== Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) ==
folgende Änderung ist notwendig, bis ein angepasster Boinc-Client herausgebracht wird.

Durch Verwendung eines Flags in der cc_config.xml kann man z.B. bei einem Quad Core "5" Kerne crunchen lassen. Sprich 4x CPU 1x GPU. (Sonst nur 3x CPU 1x GPU möglich).

Zuerst den Boincmanager / Boinc komplett schließen.

Falls die Datei''' cc_config.xml''' nicht in eurem boinc-ordner (Datenordner, bei den neueren Boincs ist dieser getrennt vom Programmordner, meist unter Anwendungsdaten zu finden'. Falls die Datei nicht existiert, einfach anlegen (einfache Textdatei z.B. mit Notepad, Editor, Wordpad).

Unter Vista64 muss die Datei hier angelegt werden: C:\ProgramData\BOINC
Unter XP muss die Datei hier angelegt werden: ''[BITTE JEMAND DEN PFAD EINFÜGEN!]''

Der Ordner ist versteckt muss also sichtbar gemacht werden, oder in der Explorersuche in den erweiterten Suchfunktionen angeben , dass Systemordner und versteckte Dateien mit durchsucht werden müssen

----
<cc_config>

<options>

<ncpus>8</ncpus>

</options>

</cc_config>

----

Danach den Boincmanager / Boinc neu starten. Man sollte nun unter Meldungen die Meldung "Reading preferences override file" sehen und unter "Aufgaben" dass alle Kerne rechnen.

'''Angenehmer Nebeneffekt: Bunkererhöhung'''
Alle Projekte die nur einen Bunker von X WUs/Core zulassen, ziehen sich auch entsprechend mehr. Ich habe z.B. auf 8 Cores erhöht, jetzt laufen 7 Instanzen Spinhenge und eine Ps3Grid. (Frisst natürlich auch mehr RAM und ggf. wird auch die Berechnung verlangsamt weil die CPU / der Speicher zu viel zu tun hat). PS3Grid bunkert z.B. nun auch 8 statt 4 WUs

== Weblinks ==

* [http://www.ps3grid.net www.ps3grid.net] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598 Planet 3DNow! Teamstatistik]

{{NaviBlock
|Vorlage:Navigationsleiste BOINC
|Navigationsleiste Nicht-BOINC
}}

[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]

GPUGRID

2008-09-14T15:56:14Z

JKuehl: /* Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) */

{| {{Steckbrief}}
|-
| {{Steckbrief Kategorie|Chemie}}
|-
| {{Steckbrief Betreiber|Research Unit of Biomedical Informatics, Barcelona Biomedical Research Park}}
|-
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|-
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|-
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|-
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|}

'''PS3GRID''' simuliert den Ionen-Transport von [http://de.wikipedia.org/wiki/Gramicidin Gramicidin]-A-Atomen. Unter den [[BOINC]]-Projekten nimmt PS3GRID eine Sonderstellung ein, da für die Berechnungen vordergründig die Spielekonsole Sony Playstation 3 sowie neuere NVIDIA-Grafikkarten eingesetzt werden.

== Projektbeschreibung ==

PS3GRID/GPUGRID stellt eine Supercomputer-Infrastruktur dar, die es Forschern ermöglichst dynamische biomolekulare Prozesse auf der Ebene von Atome zu visualisieren und diese somit besser zu verstehen. Verwendet wird dabei sie sogenannte Full-Atom Molecular Dynamics-Methode. Bei diesen Berechnungen werden die Abstände von mehreren 10.000 Atomen in einem simulierten Protein/Membranfragment zueinander innerhalb von sehr kurzen Zeitabständen berechnet. Üblicherweise liegen die Zeitabstände im Femtosekunden-Bereich (10E minus 15 Sekunden).
Für die Berechnung/Visualisierung von biologisch relevanten Prozessen, wie beispielsweise der Durchgang eines Ions durch einen entsprechenden Ionenkanal in der Membran einer Zelle [http://www.ps3grid.net/img/movie.gif] bedarf es einer enormen Rechenleistung. Die zu visualisierenden biologischen Prozesse laufen Üblicherweise im Bereich von hundertstel-Sekunden bis Millisekunden ab (10E minus 2 bis 10E minus 6). Um diesen Vorgang berechnen/visualisieren zu können, müssen die Abstände aller Atome in der zu untersuchenden "Probe" berechnet werden und dies zu jeder Femtosekunde. Um eine Millisekunde eines dynamischen Prozesses zu berechnen, müssen demnach ~150 Millionen mal alle Abstände aller Atome zueinander berechnet werden. Bei 30.000 Atomen, wie in dem aktuell (Stand September 2008) berechneten Kalium-Kanal GramidicinA, wird deutlich wie rechenintensiv diese Art von Berechnungen sind.

== Erfolge des Projekts ==

Am September 6, 2008 hat das Projekt PS3GRID-GPUGRID die Marke von 1.000.000 Credits pro Tag erreicht.

== Planet 3DNow! ==

Planet 3DNow! nimmt seit dem 18.07.2008 mit einem eigenen Team an PS3GRID teil; die ersten Credits gab es am 15.08.2008.

Am 10.09.2008 erreichte der grüne Planet seine ersten 1.000.000 Credits, 22 Active members waren gemeldet.

== Teilnahme ==

PS3GRID bietet derzeit 2 verschiedene Möglichkeiten der Teilname. Zum Einen natürlich mittels einer Playstation 3, welche dem Projekt auch den Namen verleiht.

Seit dem 17.07. 2008 ist es ebenfalls möglich, mittels einer CUDA-fähigen NVIDIA-Grafikkarte teilzunehmen. Geeignet sind jedoch nur jene mit "compute capabilities" Level 1.1 oder höher. Karten die auf der G80-GPU (Geforce 8800 GTS 320/640, GTX und Ultra) basieren können nicht am Projekt teilnehmen, sie unterstützen nur das "compute capability" Level 1.0.
Die Betreiber empfehlen weiterhin Karten mit mindestens 50 Streamprozessoren (Shadern).

Derzeit (September 2008) wären das demnach:

'''NVIDIA-Geforce-8-Serie:'''
96 Shader: Geforce 8800 GS
112 Shader: Geforce 8800 GT
128 Shader: Geforce 8800 GTS 512/1024 MiB

'''NVIDIA-Geforce-9-Serie:'''
64 Shader: Geforce 9600 GT
96 Shader: Geforce 9600 GSO
112 Shader: Geforce 9800 GT
128 Shader: Geforce 9800 GTX, Geforce 9800 GTX+
2x128 Shader: Geforce 9800 GX2

'''NVIDIA-Geforce-200-Serie''':
192 Shader: Geforce GTX 260
240 Shader: Geforce GTX 280

Auf Karten mit weniger Streamprozessoren läuft das Projekt ebenfalls, allerdings können die Berechnungszeiten dann die 4 Tage betragende Deadline überschreiten.

Weiterhin notwendig ist ein [http://www.nvidia.com/object/cuda_get.html CUDA-fähiger Treiber] von NVIDIA sowie ein BOINC-Client mit einer Versionsnummer ab [http://boinc.berkeley.edu/dl/?C=M;O=D 6.3.10.] . Empfohlen werden für Treiber und BOINC-Client jeweils die aktuellsten Versionen.

'''''Update :''''' seit dem 12.09.2008 wird für die Gridberechnung unter Linux ''kein'' kompletter Kern mehr beansprucht! Windows User müssen noch warten bis der 6.3.11´er Boinc Manager da ist.

Grafiktreiber und BOINC-Client werden nun installiert, das Vorgehen kann je nach Betriebssystem bzw. Distribution variieren.
Unter Linux gilt es zu beachten, dass der Benutzer, der BOINC startet, auch Mitglied der Gruppe ''video'' sein muss. Heißt der Benutzer etwa ''boinc'', ist dieses mit dem Befehl ''usermod -G video boinc'' umgehend erledigt. Ist der Benutzer nicht Mitglied dieser Gruppe, wird die Grafikkarte nicht als Coprozessor erkannt.

Für Windows ist noch anzumerken, dass bei der Installation von BOINC der getrennte Speicherbereich deaktiviert werden muss, da sonst BOINC beim Start diese Meldung anzeigt:

26.08.2008 10:58:57 [---] CUDA devices found
26.08.2008 10:58:57 [---] Coprocessor: Device Emulation (CPU) (1)

'''''Achtung:''''' Da der getrennte Speicherbereich nachträglich nicht deaktiviert werden kann, muss der BOINC-Client neu installiert werden. Siehe dazu auch [[Portal:BOINC/Installation/Windows#Installation_des_Clients_(ab_Version_6.x.x)|Installation des BOINC-Clients 6.x.x]]

Wenn alles richtig eingerichtet ist, zeigt BOINC nun bei jedem Start eine Nachricht wie die folgende an:

14-Aug-2008 19:04:53 [---] CUDA devices found
14-Aug-2008 19:04:53 [---] Coprocessor: GeForce 9800 GT (1)

Nun kann der Computer über die Anmeldeadresse [http://www.ps3grid.net/ http://www.ps3grid.net/] dem Projekt beitreten. Daraufhin erhält er pro und GPU-Kern jeweils eine [[Work-Unit]]. Aktuell wird jeweils 1 CPU-Kern zusätzlich zum GPU-Kern belegt. Laut Betreiberauskunft wird das in zukünftigen Programmversion nicht mehr der Fall sein. Der zusätzlich von der PS3GRID-Applikation belegte CPU-Kern arbeitet dann wieder unabhängig vom GPU-Kern und kann somit für weitere BOINC-Projekte rechnen.

== Rechenzeiten ==

{| class="dcw_fullWidthTable"
! class="dcw_normalTableCell" | '''Kartenbezeichnung'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Chiptakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Shadertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Speichertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''OS'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Treiber'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''PS3GRID App'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Rechenzeit'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Zeit pro Schritt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Benutzer'''
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce GTX 280
! class="dcw_normalTableCell" | 684Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1458Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1296Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 25150s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5503 indiana@seti]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1484Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 29576s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=3961 JKuehl]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Sparkle Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1750Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 31734s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_host_detail.php?hostid=7652 FeuerKater]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Colorful GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.450Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 32705s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5877 HGW]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 796Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1976hz
! class="dcw_normalTableCell" | 1137Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 33567s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5402 woever]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte 9800GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 740Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1836Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1100Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit HomePre.
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36550s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=6077 JagDoc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Leadtek Geforce 8800 GTS 512 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 725 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36700s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 8800 GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 750MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1806MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.35
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36761s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5615 Pjack]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | PNY Geforce 8800 GT 256 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 650 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1800 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32 bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 43400s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 729MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 44800s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/results.php?hostid=8437 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce 8800GTS
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 972Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 46000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 730MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 53,181ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 49000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1512MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 69,402 ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | inno3D Geforce 9600 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP3 32-Bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.84
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 86191s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5858 Nero24]
|}

== Banner ==

[[Bild:Banner PS3GRID.jpg]]

== Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) ==
folgende Änderung ist notwendig, bis ein angepasster Boinc-Client herausgebracht wird.

Durch Verwendung eines Flags in der cc_config.xml kann man z.B. bei einem Quad Core "5" Kerne crunchen lassen. Sprich 4x CPU 1x GPU. (Sonst nur 3x CPU 1x GPU möglich).

Zuerst den Boincmanager / Boinc komplett schließen.

Falls die Datei''' cc_config.xml''' nicht in eurem boinc-ordner (Datenordner, bei den neueren Boincs ist dieser getrennt vom Programmordner, meist unter Anwendungsdaten zu finden'' [Bitte jemand mal konkretisieren, ich hab das nicht im Kopf wo die Ordner unter XP und Vista genau sind]'' existiert, einfach anlegen (einfache Textdatei z.B. mit Notepad, Editor, Wordpad).

----
<cc_config>

<options>

<ncpus>8</ncpus>

</options>

</cc_config>

----

Danach den Boincmanager / Boinc neu starten. Man sollte nun unter Meldungen die Meldung "Reading preferences override file" sehen und unter "Aufgaben" dass alle Kerne rechnen.

'''Angenehmer Nebeneffekt: Bunkererhöhung'''
Alle Projekte die nur einen Bunker von X WUs/Core zulassen, ziehen sich auch entsprechend mehr. Ich habe z.B. auf 8 Cores erhöht, jetzt laufen 7 Instanzen Spinhenge und eine Ps3Grid. (Frisst natürlich auch mehr RAM und ggf. wird auch die Berechnung verlangsamt weil die CPU / der Speicher zu viel zu tun hat). PS3Grid bunkert z.B. nun auch 8 statt 4 WUs

== Weblinks ==

* [http://www.ps3grid.net www.ps3grid.net] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598 Planet 3DNow! Teamstatistik]

{{NaviBlock
|Vorlage:Navigationsleiste BOINC
|Navigationsleiste Nicht-BOINC
}}

[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]

GPUGRID

2008-09-14T15:55:34Z

JKuehl: Bunkererhöhung eingefügt, Konkretisierung Ordner cc_config.xml

{| {{Steckbrief}}
|-
| {{Steckbrief Kategorie|Chemie}}
|-
| {{Steckbrief Betreiber|Research Unit of Biomedical Informatics, Barcelona Biomedical Research Park}}
|-
| {{Steckbrief Nationalität|Spanien|es}}
|-
| {{Steckbrief Start|Februar 2007}}
|-
| {{Steckbrief Status|?}}
|-
| {{Steckbrief Checkpoints|Ja}}
|-
| {{Steckbrief Webseite|URL=http://www.ps3grid.net|Name=www.ps3grid.net}}
|-
| {{Steckbrief Anmeldung|URL=http://www.ps3grid.net/}}
|-
| {{Steckbrief Clients Systeme}}
|-
| {{Steckbrief Clients Architektur|GPU ([[CUDA]])|Alpha|Beta|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief Clients Architektur|[[Cell]] (PS3)|-|x|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik|URL=http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik Live|Name=PS3GRID}}
|}

'''PS3GRID''' simuliert den Ionen-Transport von [http://de.wikipedia.org/wiki/Gramicidin Gramicidin]-A-Atomen. Unter den [[BOINC]]-Projekten nimmt PS3GRID eine Sonderstellung ein, da für die Berechnungen vordergründig die Spielekonsole Sony Playstation 3 sowie neuere NVIDIA-Grafikkarten eingesetzt werden.

== Projektbeschreibung ==

PS3GRID/GPUGRID stellt eine Supercomputer-Infrastruktur dar, die es Forschern ermöglichst dynamische biomolekulare Prozesse auf der Ebene von Atome zu visualisieren und diese somit besser zu verstehen. Verwendet wird dabei sie sogenannte Full-Atom Molecular Dynamics-Methode. Bei diesen Berechnungen werden die Abstände von mehreren 10.000 Atomen in einem simulierten Protein/Membranfragment zueinander innerhalb von sehr kurzen Zeitabständen berechnet. Üblicherweise liegen die Zeitabstände im Femtosekunden-Bereich (10E minus 15 Sekunden).
Für die Berechnung/Visualisierung von biologisch relevanten Prozessen, wie beispielsweise der Durchgang eines Ions durch einen entsprechenden Ionenkanal in der Membran einer Zelle [http://www.ps3grid.net/img/movie.gif] bedarf es einer enormen Rechenleistung. Die zu visualisierenden biologischen Prozesse laufen Üblicherweise im Bereich von hundertstel-Sekunden bis Millisekunden ab (10E minus 2 bis 10E minus 6). Um diesen Vorgang berechnen/visualisieren zu können, müssen die Abstände aller Atome in der zu untersuchenden "Probe" berechnet werden und dies zu jeder Femtosekunde. Um eine Millisekunde eines dynamischen Prozesses zu berechnen, müssen demnach ~150 Millionen mal alle Abstände aller Atome zueinander berechnet werden. Bei 30.000 Atomen, wie in dem aktuell (Stand September 2008) berechneten Kalium-Kanal GramidicinA, wird deutlich wie rechenintensiv diese Art von Berechnungen sind.

== Erfolge des Projekts ==

Am September 6, 2008 hat das Projekt PS3GRID-GPUGRID die Marke von 1.000.000 Credits pro Tag erreicht.

== Planet 3DNow! ==

Planet 3DNow! nimmt seit dem 18.07.2008 mit einem eigenen Team an PS3GRID teil; die ersten Credits gab es am 15.08.2008.

Am 10.09.2008 erreichte der grüne Planet seine ersten 1.000.000 Credits, 22 Active members waren gemeldet.

== Teilnahme ==

PS3GRID bietet derzeit 2 verschiedene Möglichkeiten der Teilname. Zum Einen natürlich mittels einer Playstation 3, welche dem Projekt auch den Namen verleiht.

Seit dem 17.07. 2008 ist es ebenfalls möglich, mittels einer CUDA-fähigen NVIDIA-Grafikkarte teilzunehmen. Geeignet sind jedoch nur jene mit "compute capabilities" Level 1.1 oder höher. Karten die auf der G80-GPU (Geforce 8800 GTS 320/640, GTX und Ultra) basieren können nicht am Projekt teilnehmen, sie unterstützen nur das "compute capability" Level 1.0.
Die Betreiber empfehlen weiterhin Karten mit mindestens 50 Streamprozessoren (Shadern).

Derzeit (September 2008) wären das demnach:

'''NVIDIA-Geforce-8-Serie:'''
96 Shader: Geforce 8800 GS
112 Shader: Geforce 8800 GT
128 Shader: Geforce 8800 GTS 512/1024 MiB

'''NVIDIA-Geforce-9-Serie:'''
64 Shader: Geforce 9600 GT
96 Shader: Geforce 9600 GSO
112 Shader: Geforce 9800 GT
128 Shader: Geforce 9800 GTX, Geforce 9800 GTX+
2x128 Shader: Geforce 9800 GX2

'''NVIDIA-Geforce-200-Serie''':
192 Shader: Geforce GTX 260
240 Shader: Geforce GTX 280

Auf Karten mit weniger Streamprozessoren läuft das Projekt ebenfalls, allerdings können die Berechnungszeiten dann die 4 Tage betragende Deadline überschreiten.

Weiterhin notwendig ist ein [http://www.nvidia.com/object/cuda_get.html CUDA-fähiger Treiber] von NVIDIA sowie ein BOINC-Client mit einer Versionsnummer ab [http://boinc.berkeley.edu/dl/?C=M;O=D 6.3.10.] . Empfohlen werden für Treiber und BOINC-Client jeweils die aktuellsten Versionen.

'''''Update :''''' seit dem 12.09.2008 wird für die Gridberechnung unter Linux ''kein'' kompletter Kern mehr beansprucht! Windows User müssen noch warten bis der 6.3.11´er Boinc Manager da ist.

Grafiktreiber und BOINC-Client werden nun installiert, das Vorgehen kann je nach Betriebssystem bzw. Distribution variieren.
Unter Linux gilt es zu beachten, dass der Benutzer, der BOINC startet, auch Mitglied der Gruppe ''video'' sein muss. Heißt der Benutzer etwa ''boinc'', ist dieses mit dem Befehl ''usermod -G video boinc'' umgehend erledigt. Ist der Benutzer nicht Mitglied dieser Gruppe, wird die Grafikkarte nicht als Coprozessor erkannt.

Für Windows ist noch anzumerken, dass bei der Installation von BOINC der getrennte Speicherbereich deaktiviert werden muss, da sonst BOINC beim Start diese Meldung anzeigt:

26.08.2008 10:58:57 [---] CUDA devices found
26.08.2008 10:58:57 [---] Coprocessor: Device Emulation (CPU) (1)

'''''Achtung:''''' Da der getrennte Speicherbereich nachträglich nicht deaktiviert werden kann, muss der BOINC-Client neu installiert werden. Siehe dazu auch [[Portal:BOINC/Installation/Windows#Installation_des_Clients_(ab_Version_6.x.x)|Installation des BOINC-Clients 6.x.x]]

Wenn alles richtig eingerichtet ist, zeigt BOINC nun bei jedem Start eine Nachricht wie die folgende an:

14-Aug-2008 19:04:53 [---] CUDA devices found
14-Aug-2008 19:04:53 [---] Coprocessor: GeForce 9800 GT (1)

Nun kann der Computer über die Anmeldeadresse [http://www.ps3grid.net/ http://www.ps3grid.net/] dem Projekt beitreten. Daraufhin erhält er pro und GPU-Kern jeweils eine [[Work-Unit]]. Aktuell wird jeweils 1 CPU-Kern zusätzlich zum GPU-Kern belegt. Laut Betreiberauskunft wird das in zukünftigen Programmversion nicht mehr der Fall sein. Der zusätzlich von der PS3GRID-Applikation belegte CPU-Kern arbeitet dann wieder unabhängig vom GPU-Kern und kann somit für weitere BOINC-Projekte rechnen.

== Rechenzeiten ==

{| class="dcw_fullWidthTable"
! class="dcw_normalTableCell" | '''Kartenbezeichnung'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Chiptakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Shadertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Speichertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''OS'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Treiber'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''PS3GRID App'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Rechenzeit'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Zeit pro Schritt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Benutzer'''
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce GTX 280
! class="dcw_normalTableCell" | 684Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1458Mhz
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! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
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! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5503 indiana@seti]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1484Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 29576s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=3961 JKuehl]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Sparkle Geforce 8800GT
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! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 31734s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_host_detail.php?hostid=7652 FeuerKater]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Colorful GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.450Mhz
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! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 32705s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5877 HGW]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 796Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1976hz
! class="dcw_normalTableCell" | 1137Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 33567s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5402 woever]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte 9800GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 740Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1836Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1100Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit HomePre.
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36550s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=6077 JagDoc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Leadtek Geforce 8800 GTS 512 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 725 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36700s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 8800 GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 750MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1806MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.35
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36761s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5615 Pjack]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | PNY Geforce 8800 GT 256 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 650 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1800 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32 bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 43400s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 729MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
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! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/results.php?hostid=8437 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce 8800GTS
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 972Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
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! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 730MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 53,181ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 49000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1512MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 69,402 ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | inno3D Geforce 9600 GT
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! class="dcw_normalTableCell" | 1600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP3 32-Bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.84
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
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! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5858 Nero24]
|}

== Banner ==

[[Bild:Banner PS3GRID.jpg]]

== Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) ==
folgende Änderung ist notwendig, bis ein angepasster Boinc-Client herausgebracht wird.

Durch Verwendung eines Flags in der cc_config.xml kann man z.B. bei einem Quad Core "5" Kerne crunchen lassen. Sprich 4x CPU 1x GPU. (Sonst nur 3x CPU 1x GPU möglich).

Zuerst den Boincmanager / Boinc komplett schließen.

Falls die Datei''' cc_config.xml''' nicht in eurem boinc-ordner (Datenordner, bei den neueren Boincs ist dieser getrennt vom Programmordner, meist unter Anwendungsdaten zu finden'' [Bitte jemand mal konkretisieren, ich hab das nicht im Kopf wo die Ordner unter XP und Vista genau sind]'' existiert, einfach anlegen (einfache Textdatei z.B. mit Notepad, Editor, Wordpad).

----
<cc_config>

<options>

<ncpus>8</ncpus>

</options>

</cc_config>

----

Danach den Boincmanager / Boinc neu starten. Man sollte nun unter Meldungen die Meldung "Reading preferences override file" sehen und unter "Aufgaben" dass alle Kerne rechnen.

'''Angenehmer Nebeneffekt:' Bunkererhöhung''
Alle Projekte die nur einen Bunker von X WUs/Core zulassen, ziehen sich auch entsprechend mehr. Ich habe z.B. auf 8 Cores erhöht, jetzt laufen 7 Instanzen Spinhenge und eine Ps3Grid. (Frisst natürlich auch mehr RAM und ggf. wird auch die Berechnung verlangsamt weil die CPU / der Speicher zu viel zu tun hat). PS3Grid bunkert z.B. nun auch 8 statt 4 WUs

== Weblinks ==

* [http://www.ps3grid.net www.ps3grid.net] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598 Planet 3DNow! Teamstatistik]

{{NaviBlock
|Vorlage:Navigationsleiste BOINC
|Navigationsleiste Nicht-BOINC
}}

[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]

GPUGRID

2008-09-14T15:09:52Z

JKuehl: /* Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) */

{| {{Steckbrief}}
|-
| {{Steckbrief Kategorie|Chemie}}
|-
| {{Steckbrief Betreiber|Research Unit of Biomedical Informatics, Barcelona Biomedical Research Park}}
|-
| {{Steckbrief Nationalität|Spanien|es}}
|-
| {{Steckbrief Start|Februar 2007}}
|-
| {{Steckbrief Status|?}}
|-
| {{Steckbrief Checkpoints|Ja}}
|-
| {{Steckbrief Webseite|URL=http://www.ps3grid.net|Name=www.ps3grid.net}}
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|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik|URL=http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik Live|Name=PS3GRID}}
|}

'''PS3GRID''' simuliert den Ionen-Transport von [http://de.wikipedia.org/wiki/Gramicidin Gramicidin]-A-Atomen. Unter den [[BOINC]]-Projekten nimmt PS3GRID eine Sonderstellung ein, da für die Berechnungen vordergründig die Spielekonsole Sony Playstation 3 sowie neuere NVIDIA-Grafikkarten eingesetzt werden.

== Projektbeschreibung ==

PS3GRID/GPUGRID stellt eine Supercomputer-Infrastruktur dar, die es Forschern ermöglichst dynamische biomolekulare Prozesse auf der Ebene von Atome zu visualisieren und diese somit besser zu verstehen. Verwendet wird dabei sie sogenannte Full-Atom Molecular Dynamics-Methode. Bei diesen Berechnungen werden die Abstände von mehreren 10.000 Atomen in einem simulierten Protein/Membranfragment zueinander innerhalb von sehr kurzen Zeitabständen berechnet. Üblicherweise liegen die Zeitabstände im Femtosekunden-Bereich (10E minus 15 Sekunden).
Für die Berechnung/Visualisierung von biologisch relevanten Prozessen, wie beispielsweise der Durchgang eines Ions durch einen entsprechenden Ionenkanal in der Membran einer Zelle [http://www.ps3grid.net/img/movie.gif] bedarf es einer enormen Rechenleistung. Die zu visualisierenden biologischen Prozesse laufen Üblicherweise im Bereich von hundertstel-Sekunden bis Millisekunden ab (10E minus 2 bis 10E minus 6). Um diesen Vorgang berechnen/visualisieren zu können, müssen die Abstände aller Atome in der zu untersuchenden "Probe" berechnet werden und dies zu jeder Femtosekunde. Um eine Millisekunde eines dynamischen Prozesses zu berechnen, müssen demnach ~150 Millionen mal alle Abstände aller Atome zueinander berechnet werden. Bei 30.000 Atomen, wie in dem aktuell (Stand September 2008) berechneten Kalium-Kanal GramidicinA, wird deutlich wie rechenintensiv diese Art von Berechnungen sind.

== Erfolge des Projekts ==

Am September 6, 2008 hat das Projekt PS3GRID-GPUGRID die Marke von 1.000.000 Credits pro Tag erreicht.

== Planet 3DNow! ==

Planet 3DNow! nimmt seit dem 18.07.2008 mit einem eigenen Team an PS3GRID teil; die ersten Credits gab es am 15.08.2008.

Am 10.09.2008 erreichte der grüne Planet seine ersten 1.000.000 Credits, 22 Active members waren gemeldet.

== Teilnahme ==

PS3GRID bietet derzeit 2 verschiedene Möglichkeiten der Teilname. Zum Einen natürlich mittels einer Playstation 3, welche dem Projekt auch den Namen verleiht.

Seit dem 17.07. 2008 ist es ebenfalls möglich, mittels einer CUDA-fähigen NVIDIA-Grafikkarte teilzunehmen. Geeignet sind jedoch nur jene mit "compute capabilities" Level 1.1 oder höher. Karten die auf der G80-GPU (Geforce 8800 GTS 320/640, GTX und Ultra) basieren können nicht am Projekt teilnehmen, sie unterstützen nur das "compute capability" Level 1.0.
Die Betreiber empfehlen weiterhin Karten mit mindestens 50 Streamprozessoren (Shadern).

Derzeit (September 2008) wären das demnach:

'''NVIDIA-Geforce-8-Serie:'''
96 Shader: Geforce 8800 GS
112 Shader: Geforce 8800 GT
128 Shader: Geforce 8800 GTS 512/1024 MiB

'''NVIDIA-Geforce-9-Serie:'''
64 Shader: Geforce 9600 GT
96 Shader: Geforce 9600 GSO
112 Shader: Geforce 9800 GT
128 Shader: Geforce 9800 GTX, Geforce 9800 GTX+
2x128 Shader: Geforce 9800 GX2

'''NVIDIA-Geforce-200-Serie''':
192 Shader: Geforce GTX 260
240 Shader: Geforce GTX 280

Auf Karten mit weniger Streamprozessoren läuft das Projekt ebenfalls, allerdings können die Berechnungszeiten dann die 4 Tage betragende Deadline überschreiten.

Weiterhin notwendig ist ein [http://www.nvidia.com/object/cuda_get.html CUDA-fähiger Treiber] von NVIDIA sowie ein BOINC-Client mit einer Versionsnummer ab [http://boinc.berkeley.edu/dl/?C=M;O=D 6.3.10.] . Empfohlen werden für Treiber und BOINC-Client jeweils die aktuellsten Versionen.

'''''Update :''''' seit dem 12.09.2008 wird für die Gridberechnung unter Linux ''kein'' kompletter Kern mehr beansprucht! Windows User müssen noch warten bis der 6.3.11´er Boinc Manager da ist.

Grafiktreiber und BOINC-Client werden nun installiert, das Vorgehen kann je nach Betriebssystem bzw. Distribution variieren.
Unter Linux gilt es zu beachten, dass der Benutzer, der BOINC startet, auch Mitglied der Gruppe ''video'' sein muss. Heißt der Benutzer etwa ''boinc'', ist dieses mit dem Befehl ''usermod -G video boinc'' umgehend erledigt. Ist der Benutzer nicht Mitglied dieser Gruppe, wird die Grafikkarte nicht als Coprozessor erkannt.

Für Windows ist noch anzumerken, dass bei der Installation von BOINC der getrennte Speicherbereich deaktiviert werden muss, da sonst BOINC beim Start diese Meldung anzeigt:

26.08.2008 10:58:57 [---] CUDA devices found
26.08.2008 10:58:57 [---] Coprocessor: Device Emulation (CPU) (1)

'''''Achtung:''''' Da der getrennte Speicherbereich nachträglich nicht deaktiviert werden kann, muss der BOINC-Client neu installiert werden. Siehe dazu auch [[Portal:BOINC/Installation/Windows#Installation_des_Clients_(ab_Version_6.x.x)|Installation des BOINC-Clients 6.x.x]]

Wenn alles richtig eingerichtet ist, zeigt BOINC nun bei jedem Start eine Nachricht wie die folgende an:

14-Aug-2008 19:04:53 [---] CUDA devices found
14-Aug-2008 19:04:53 [---] Coprocessor: GeForce 9800 GT (1)

Nun kann der Computer über die Anmeldeadresse [http://www.ps3grid.net/ http://www.ps3grid.net/] dem Projekt beitreten. Daraufhin erhält er pro und GPU-Kern jeweils eine [[Work-Unit]]. Aktuell wird jeweils 1 CPU-Kern zusätzlich zum GPU-Kern belegt. Laut Betreiberauskunft wird das in zukünftigen Programmversion nicht mehr der Fall sein. Der zusätzlich von der PS3GRID-Applikation belegte CPU-Kern arbeitet dann wieder unabhängig vom GPU-Kern und kann somit für weitere BOINC-Projekte rechnen.

== Rechenzeiten ==

{| class="dcw_fullWidthTable"
! class="dcw_normalTableCell" | '''Kartenbezeichnung'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Chiptakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Shadertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Speichertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''OS'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Treiber'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''PS3GRID App'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Rechenzeit'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Zeit pro Schritt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Benutzer'''
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce GTX 280
! class="dcw_normalTableCell" | 684Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1458Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1296Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 25150s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5503 indiana@seti]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1484Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 29576s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=3961 JKuehl]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Sparkle Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1750Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 31734s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_host_detail.php?hostid=7652 FeuerKater]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Colorful GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.450Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 32705s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5877 HGW]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 796Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1976hz
! class="dcw_normalTableCell" | 1137Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 33567s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5402 woever]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte 9800GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 740Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1836Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1100Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit HomePre.
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36550s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=6077 JagDoc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Leadtek Geforce 8800 GTS 512 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 725 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36700s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 8800 GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 750MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1806MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.35
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36761s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5615 Pjack]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | PNY Geforce 8800 GT 256 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 650 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1800 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32 bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 43400s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 729MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 44800s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/results.php?hostid=8437 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce 8800GTS
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 972Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 46000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 730MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 53,181ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 49000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1512MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
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! class="dcw_normalTableCell" | 69,402 ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | inno3D Geforce 9600 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP3 32-Bit
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! class="dcw_normalTableCell" |
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|}

== Banner ==

[[Bild:Banner PS3GRID.jpg]]

== Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) ==
folgende Änderung ist notwendig, bis ein angepasster Boinc-Client herausgebracht wird.

Durch Verwendung eines Flags in der cc_config.xml kann man z.B. bei einem Quad Core "5" Kerne crunchen lassen. Sprich 4x CPU 1x GPU. (Sonst nur 3x CPU 1x GPU möglich).

Zuerst den Boincmanager / Boinc komplett schließen.

Falls die Datei''' cc_config.xml''' nicht in eurem boinc-ordner existiert, einfach anlegen (einfache Textdatei z.B. mit Notepad, Editor, Wordpad).

----
<cc_config>

<options>

<ncpus>8</ncpus>

</options>

</cc_config>

----

Danach den Boincmanager / Boinc neu starten. Man sollte nun unter Meldungen die Meldung "Reading preferences override file" sehen und unter "Aufgaben" dass alle Kerne rechnen.

== Weblinks ==

* [http://www.ps3grid.net www.ps3grid.net] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598 Planet 3DNow! Teamstatistik]

{{NaviBlock
|Vorlage:Navigationsleiste BOINC
|Navigationsleiste Nicht-BOINC
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[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]

GPUGRID

2008-09-14T15:07:47Z

JKuehl: /* Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) */

{| {{Steckbrief}}
|-
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|-
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|-
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|-
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| {{Steckbrief Clients Architektur|[[Cell]] (PS3)|-|x|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik|URL=http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik Live|Name=PS3GRID}}
|}

'''PS3GRID''' simuliert den Ionen-Transport von [http://de.wikipedia.org/wiki/Gramicidin Gramicidin]-A-Atomen. Unter den [[BOINC]]-Projekten nimmt PS3GRID eine Sonderstellung ein, da für die Berechnungen vordergründig die Spielekonsole Sony Playstation 3 sowie neuere NVIDIA-Grafikkarten eingesetzt werden.

== Projektbeschreibung ==

PS3GRID/GPUGRID stellt eine Supercomputer-Infrastruktur dar, die es Forschern ermöglichst dynamische biomolekulare Prozesse auf der Ebene von Atome zu visualisieren und diese somit besser zu verstehen. Verwendet wird dabei sie sogenannte Full-Atom Molecular Dynamics-Methode. Bei diesen Berechnungen werden die Abstände von mehreren 10.000 Atomen in einem simulierten Protein/Membranfragment zueinander innerhalb von sehr kurzen Zeitabständen berechnet. Üblicherweise liegen die Zeitabstände im Femtosekunden-Bereich (10E minus 15 Sekunden).
Für die Berechnung/Visualisierung von biologisch relevanten Prozessen, wie beispielsweise der Durchgang eines Ions durch einen entsprechenden Ionenkanal in der Membran einer Zelle [http://www.ps3grid.net/img/movie.gif] bedarf es einer enormen Rechenleistung. Die zu visualisierenden biologischen Prozesse laufen Üblicherweise im Bereich von hundertstel-Sekunden bis Millisekunden ab (10E minus 2 bis 10E minus 6). Um diesen Vorgang berechnen/visualisieren zu können, müssen die Abstände aller Atome in der zu untersuchenden "Probe" berechnet werden und dies zu jeder Femtosekunde. Um eine Millisekunde eines dynamischen Prozesses zu berechnen, müssen demnach ~150 Millionen mal alle Abstände aller Atome zueinander berechnet werden. Bei 30.000 Atomen, wie in dem aktuell (Stand September 2008) berechneten Kalium-Kanal GramidicinA, wird deutlich wie rechenintensiv diese Art von Berechnungen sind.

== Erfolge des Projekts ==

Am September 6, 2008 hat das Projekt PS3GRID-GPUGRID die Marke von 1.000.000 Credits pro Tag erreicht.

== Planet 3DNow! ==

Planet 3DNow! nimmt seit dem 18.07.2008 mit einem eigenen Team an PS3GRID teil; die ersten Credits gab es am 15.08.2008.

Am 10.09.2008 erreichte der grüne Planet seine ersten 1.000.000 Credits, 22 Active members waren gemeldet.

== Teilnahme ==

PS3GRID bietet derzeit 2 verschiedene Möglichkeiten der Teilname. Zum Einen natürlich mittels einer Playstation 3, welche dem Projekt auch den Namen verleiht.

Seit dem 17.07. 2008 ist es ebenfalls möglich, mittels einer CUDA-fähigen NVIDIA-Grafikkarte teilzunehmen. Geeignet sind jedoch nur jene mit "compute capabilities" Level 1.1 oder höher. Karten die auf der G80-GPU (Geforce 8800 GTS 320/640, GTX und Ultra) basieren können nicht am Projekt teilnehmen, sie unterstützen nur das "compute capability" Level 1.0.
Die Betreiber empfehlen weiterhin Karten mit mindestens 50 Streamprozessoren (Shadern).

Derzeit (September 2008) wären das demnach:

'''NVIDIA-Geforce-8-Serie:'''
96 Shader: Geforce 8800 GS
112 Shader: Geforce 8800 GT
128 Shader: Geforce 8800 GTS 512/1024 MiB

'''NVIDIA-Geforce-9-Serie:'''
64 Shader: Geforce 9600 GT
96 Shader: Geforce 9600 GSO
112 Shader: Geforce 9800 GT
128 Shader: Geforce 9800 GTX, Geforce 9800 GTX+
2x128 Shader: Geforce 9800 GX2

'''NVIDIA-Geforce-200-Serie''':
192 Shader: Geforce GTX 260
240 Shader: Geforce GTX 280

Auf Karten mit weniger Streamprozessoren läuft das Projekt ebenfalls, allerdings können die Berechnungszeiten dann die 4 Tage betragende Deadline überschreiten.

Weiterhin notwendig ist ein [http://www.nvidia.com/object/cuda_get.html CUDA-fähiger Treiber] von NVIDIA sowie ein BOINC-Client mit einer Versionsnummer ab [http://boinc.berkeley.edu/dl/?C=M;O=D 6.3.10.] . Empfohlen werden für Treiber und BOINC-Client jeweils die aktuellsten Versionen.

'''''Update :''''' seit dem 12.09.2008 wird für die Gridberechnung unter Linux ''kein'' kompletter Kern mehr beansprucht! Windows User müssen noch warten bis der 6.3.11´er Boinc Manager da ist.

Grafiktreiber und BOINC-Client werden nun installiert, das Vorgehen kann je nach Betriebssystem bzw. Distribution variieren.
Unter Linux gilt es zu beachten, dass der Benutzer, der BOINC startet, auch Mitglied der Gruppe ''video'' sein muss. Heißt der Benutzer etwa ''boinc'', ist dieses mit dem Befehl ''usermod -G video boinc'' umgehend erledigt. Ist der Benutzer nicht Mitglied dieser Gruppe, wird die Grafikkarte nicht als Coprozessor erkannt.

Für Windows ist noch anzumerken, dass bei der Installation von BOINC der getrennte Speicherbereich deaktiviert werden muss, da sonst BOINC beim Start diese Meldung anzeigt:

26.08.2008 10:58:57 [---] CUDA devices found
26.08.2008 10:58:57 [---] Coprocessor: Device Emulation (CPU) (1)

'''''Achtung:''''' Da der getrennte Speicherbereich nachträglich nicht deaktiviert werden kann, muss der BOINC-Client neu installiert werden. Siehe dazu auch [[Portal:BOINC/Installation/Windows#Installation_des_Clients_(ab_Version_6.x.x)|Installation des BOINC-Clients 6.x.x]]

Wenn alles richtig eingerichtet ist, zeigt BOINC nun bei jedem Start eine Nachricht wie die folgende an:

14-Aug-2008 19:04:53 [---] CUDA devices found
14-Aug-2008 19:04:53 [---] Coprocessor: GeForce 9800 GT (1)

Nun kann der Computer über die Anmeldeadresse [http://www.ps3grid.net/ http://www.ps3grid.net/] dem Projekt beitreten. Daraufhin erhält er pro und GPU-Kern jeweils eine [[Work-Unit]]. Aktuell wird jeweils 1 CPU-Kern zusätzlich zum GPU-Kern belegt. Laut Betreiberauskunft wird das in zukünftigen Programmversion nicht mehr der Fall sein. Der zusätzlich von der PS3GRID-Applikation belegte CPU-Kern arbeitet dann wieder unabhängig vom GPU-Kern und kann somit für weitere BOINC-Projekte rechnen.

== Rechenzeiten ==

{| class="dcw_fullWidthTable"
! class="dcw_normalTableCell" | '''Kartenbezeichnung'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Chiptakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Shadertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Speichertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''OS'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Treiber'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''PS3GRID App'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Rechenzeit'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Zeit pro Schritt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Benutzer'''
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce GTX 280
! class="dcw_normalTableCell" | 684Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1458Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1296Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 25150s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5503 indiana@seti]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1484Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 29576s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=3961 JKuehl]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Sparkle Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1750Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 31734s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_host_detail.php?hostid=7652 FeuerKater]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Colorful GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.450Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 32705s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5877 HGW]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 796Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1976hz
! class="dcw_normalTableCell" | 1137Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 33567s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5402 woever]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte 9800GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 740Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1836Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1100Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit HomePre.
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36550s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=6077 JagDoc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Leadtek Geforce 8800 GTS 512 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 725 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36700s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 8800 GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 750MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1806MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.35
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36761s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5615 Pjack]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | PNY Geforce 8800 GT 256 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 650 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1800 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32 bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 43400s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 729MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 44800s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/results.php?hostid=8437 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce 8800GTS
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 972Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 46000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 730MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 53,181ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 49000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1512MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 69,402 ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | inno3D Geforce 9600 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP3 32-Bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.84
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 86191s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5858 Nero24]
|}

== Banner ==

[[Bild:Banner PS3GRID.jpg]]

== Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) ==
folgende Änderung ist notwendig, bis ein angepasster Boinc-Client herausgebracht wird.

Durch Verwendung eines Flags in der cc_config.xml kann man z.B. bei einem Quad Core "5" Kerne crunchen lassen. Sprich 4x CPU 1x GPU. (Sonst nur 3x CPU 1x GPU möglich).

Zuerst den Boincmanager / Boinc komplett schließen.

Falls die Datei''' cc_config.xml''' nicht in eurem boinc-ordner existiert, einfach anlegen (einfache Textdatei z.B. mit Notepad, Editor, Wordpad).

----
<nowiki><cc_config>
<options>
<ncpus>8</ncpus>
</options>
</cc_config></nowiki>
----

Danach den Boincmanager / Boinc neu starten. Man sollte nun unter Meldungen die Meldung "Reading preferences override file" sehen und unter "Aufgaben" dass alle Kerne rechnen.

== Weblinks ==

* [http://www.ps3grid.net www.ps3grid.net] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598 Planet 3DNow! Teamstatistik]

{{NaviBlock
|Vorlage:Navigationsleiste BOINC
|Navigationsleiste Nicht-BOINC
}}

[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]

GPUGRID

2008-09-14T15:07:08Z

JKuehl:

{| {{Steckbrief}}
|-
| {{Steckbrief Kategorie|Chemie}}
|-
| {{Steckbrief Betreiber|Research Unit of Biomedical Informatics, Barcelona Biomedical Research Park}}
|-
| {{Steckbrief Nationalität|Spanien|es}}
|-
| {{Steckbrief Start|Februar 2007}}
|-
| {{Steckbrief Status|?}}
|-
| {{Steckbrief Checkpoints|Ja}}
|-
| {{Steckbrief Webseite|URL=http://www.ps3grid.net|Name=www.ps3grid.net}}
|-
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|-
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|-
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|-
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|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik Live|Name=PS3GRID}}
|}

'''PS3GRID''' simuliert den Ionen-Transport von [http://de.wikipedia.org/wiki/Gramicidin Gramicidin]-A-Atomen. Unter den [[BOINC]]-Projekten nimmt PS3GRID eine Sonderstellung ein, da für die Berechnungen vordergründig die Spielekonsole Sony Playstation 3 sowie neuere NVIDIA-Grafikkarten eingesetzt werden.

== Projektbeschreibung ==

PS3GRID/GPUGRID stellt eine Supercomputer-Infrastruktur dar, die es Forschern ermöglichst dynamische biomolekulare Prozesse auf der Ebene von Atome zu visualisieren und diese somit besser zu verstehen. Verwendet wird dabei sie sogenannte Full-Atom Molecular Dynamics-Methode. Bei diesen Berechnungen werden die Abstände von mehreren 10.000 Atomen in einem simulierten Protein/Membranfragment zueinander innerhalb von sehr kurzen Zeitabständen berechnet. Üblicherweise liegen die Zeitabstände im Femtosekunden-Bereich (10E minus 15 Sekunden).
Für die Berechnung/Visualisierung von biologisch relevanten Prozessen, wie beispielsweise der Durchgang eines Ions durch einen entsprechenden Ionenkanal in der Membran einer Zelle [http://www.ps3grid.net/img/movie.gif] bedarf es einer enormen Rechenleistung. Die zu visualisierenden biologischen Prozesse laufen Üblicherweise im Bereich von hundertstel-Sekunden bis Millisekunden ab (10E minus 2 bis 10E minus 6). Um diesen Vorgang berechnen/visualisieren zu können, müssen die Abstände aller Atome in der zu untersuchenden "Probe" berechnet werden und dies zu jeder Femtosekunde. Um eine Millisekunde eines dynamischen Prozesses zu berechnen, müssen demnach ~150 Millionen mal alle Abstände aller Atome zueinander berechnet werden. Bei 30.000 Atomen, wie in dem aktuell (Stand September 2008) berechneten Kalium-Kanal GramidicinA, wird deutlich wie rechenintensiv diese Art von Berechnungen sind.

== Erfolge des Projekts ==

Am September 6, 2008 hat das Projekt PS3GRID-GPUGRID die Marke von 1.000.000 Credits pro Tag erreicht.

== Planet 3DNow! ==

Planet 3DNow! nimmt seit dem 18.07.2008 mit einem eigenen Team an PS3GRID teil; die ersten Credits gab es am 15.08.2008.

Am 10.09.2008 erreichte der grüne Planet seine ersten 1.000.000 Credits, 22 Active members waren gemeldet.

== Teilnahme ==

PS3GRID bietet derzeit 2 verschiedene Möglichkeiten der Teilname. Zum Einen natürlich mittels einer Playstation 3, welche dem Projekt auch den Namen verleiht.

Seit dem 17.07. 2008 ist es ebenfalls möglich, mittels einer CUDA-fähigen NVIDIA-Grafikkarte teilzunehmen. Geeignet sind jedoch nur jene mit "compute capabilities" Level 1.1 oder höher. Karten die auf der G80-GPU (Geforce 8800 GTS 320/640, GTX und Ultra) basieren können nicht am Projekt teilnehmen, sie unterstützen nur das "compute capability" Level 1.0.
Die Betreiber empfehlen weiterhin Karten mit mindestens 50 Streamprozessoren (Shadern).

Derzeit (September 2008) wären das demnach:

'''NVIDIA-Geforce-8-Serie:'''
96 Shader: Geforce 8800 GS
112 Shader: Geforce 8800 GT
128 Shader: Geforce 8800 GTS 512/1024 MiB

'''NVIDIA-Geforce-9-Serie:'''
64 Shader: Geforce 9600 GT
96 Shader: Geforce 9600 GSO
112 Shader: Geforce 9800 GT
128 Shader: Geforce 9800 GTX, Geforce 9800 GTX+
2x128 Shader: Geforce 9800 GX2

'''NVIDIA-Geforce-200-Serie''':
192 Shader: Geforce GTX 260
240 Shader: Geforce GTX 280

Auf Karten mit weniger Streamprozessoren läuft das Projekt ebenfalls, allerdings können die Berechnungszeiten dann die 4 Tage betragende Deadline überschreiten.

Weiterhin notwendig ist ein [http://www.nvidia.com/object/cuda_get.html CUDA-fähiger Treiber] von NVIDIA sowie ein BOINC-Client mit einer Versionsnummer ab [http://boinc.berkeley.edu/dl/?C=M;O=D 6.3.10.] . Empfohlen werden für Treiber und BOINC-Client jeweils die aktuellsten Versionen.

'''''Update :''''' seit dem 12.09.2008 wird für die Gridberechnung unter Linux ''kein'' kompletter Kern mehr beansprucht! Windows User müssen noch warten bis der 6.3.11´er Boinc Manager da ist.

Grafiktreiber und BOINC-Client werden nun installiert, das Vorgehen kann je nach Betriebssystem bzw. Distribution variieren.
Unter Linux gilt es zu beachten, dass der Benutzer, der BOINC startet, auch Mitglied der Gruppe ''video'' sein muss. Heißt der Benutzer etwa ''boinc'', ist dieses mit dem Befehl ''usermod -G video boinc'' umgehend erledigt. Ist der Benutzer nicht Mitglied dieser Gruppe, wird die Grafikkarte nicht als Coprozessor erkannt.

Für Windows ist noch anzumerken, dass bei der Installation von BOINC der getrennte Speicherbereich deaktiviert werden muss, da sonst BOINC beim Start diese Meldung anzeigt:

26.08.2008 10:58:57 [---] CUDA devices found
26.08.2008 10:58:57 [---] Coprocessor: Device Emulation (CPU) (1)

'''''Achtung:''''' Da der getrennte Speicherbereich nachträglich nicht deaktiviert werden kann, muss der BOINC-Client neu installiert werden. Siehe dazu auch [[Portal:BOINC/Installation/Windows#Installation_des_Clients_(ab_Version_6.x.x)|Installation des BOINC-Clients 6.x.x]]

Wenn alles richtig eingerichtet ist, zeigt BOINC nun bei jedem Start eine Nachricht wie die folgende an:

14-Aug-2008 19:04:53 [---] CUDA devices found
14-Aug-2008 19:04:53 [---] Coprocessor: GeForce 9800 GT (1)

Nun kann der Computer über die Anmeldeadresse [http://www.ps3grid.net/ http://www.ps3grid.net/] dem Projekt beitreten. Daraufhin erhält er pro und GPU-Kern jeweils eine [[Work-Unit]]. Aktuell wird jeweils 1 CPU-Kern zusätzlich zum GPU-Kern belegt. Laut Betreiberauskunft wird das in zukünftigen Programmversion nicht mehr der Fall sein. Der zusätzlich von der PS3GRID-Applikation belegte CPU-Kern arbeitet dann wieder unabhängig vom GPU-Kern und kann somit für weitere BOINC-Projekte rechnen.

== Rechenzeiten ==

{| class="dcw_fullWidthTable"
! class="dcw_normalTableCell" | '''Kartenbezeichnung'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Chiptakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Shadertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Speichertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''OS'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Treiber'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''PS3GRID App'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Rechenzeit'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Zeit pro Schritt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Benutzer'''
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce GTX 280
! class="dcw_normalTableCell" | 684Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1458Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1296Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 25150s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5503 indiana@seti]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
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! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 29576s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=3961 JKuehl]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Sparkle Geforce 8800GT
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! class="dcw_normalTableCell" | 1750Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 31734s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_host_detail.php?hostid=7652 FeuerKater]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Colorful GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.450Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
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! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 32705s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5877 HGW]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 796Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1976hz
! class="dcw_normalTableCell" | 1137Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
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! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5402 woever]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte 9800GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 740Mhz
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! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit HomePre.
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
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! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=6077 JagDoc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Leadtek Geforce 8800 GTS 512 MB
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! class="dcw_normalTableCell" | 1850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000 Mhz
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! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 8800 GTS 512
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! class="dcw_normalTableCell" | 1000MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.35
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
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! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5615 Pjack]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | PNY Geforce 8800 GT 256 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 650 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1800 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32 bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 43400s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 729MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 44800s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/results.php?hostid=8437 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce 8800GTS
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 972Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 46000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 730MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 53,181ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 49000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1512MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 69,402 ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | inno3D Geforce 9600 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP3 32-Bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.84
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 86191s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5858 Nero24]
|}

== Banner ==

[[Bild:Banner PS3GRID.jpg]]

== Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU) ==
folgende Änderung ist notwendig, bis ein angepasster Boinc-Client herausgebracht wird.

Durch Verwendung eines Flags in der cc_config.xml kann man z.B. bei einem Quad Core "5" Kerne crunchen lassen. Sprich 4x CPU 1x GPU. (Sonst nur 3x CPU 1x GPU möglich).

Zuerst den Boincmanager / Boinc komplett schließen.

Falls die Datei''' cc_config.xml''' nicht in eurem boinc-ordner existiert, einfach anlegen (einfache Textdatei z.B. mit Notepad, Editor, Wordpad).

----
<cc_config>
<options>
<ncpus>8</ncpus>
</options>
</cc_config>
----

Danach den Boincmanager / Boinc neu starten. Man sollte nun unter Meldungen die Meldung "Reading preferences override file" sehen und unter "Aufgaben" dass alle Kerne rechnen.

== Weblinks ==

* [http://www.ps3grid.net www.ps3grid.net] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598 Planet 3DNow! Teamstatistik]

{{NaviBlock
|Vorlage:Navigationsleiste BOINC
|Navigationsleiste Nicht-BOINC
}}

[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]

GPUGRID

2008-09-14T15:06:37Z

JKuehl: Alle Kerne nutzen eingefügt

{| {{Steckbrief}}
|-
| {{Steckbrief Kategorie|Chemie}}
|-
| {{Steckbrief Betreiber|Research Unit of Biomedical Informatics, Barcelona Biomedical Research Park}}
|-
| {{Steckbrief Nationalität|Spanien|es}}
|-
| {{Steckbrief Start|Februar 2007}}
|-
| {{Steckbrief Status|?}}
|-
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|-
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|-
| {{Steckbrief Anmeldung|URL=http://www.ps3grid.net/}}
|-
| {{Steckbrief Clients Systeme}}
|-
| {{Steckbrief Clients Architektur|GPU ([[CUDA]])|Alpha|Beta|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief Clients Architektur|[[Cell]] (PS3)|-|x|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik|URL=http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik Live|Name=PS3GRID}}
|}

'''PS3GRID''' simuliert den Ionen-Transport von [http://de.wikipedia.org/wiki/Gramicidin Gramicidin]-A-Atomen. Unter den [[BOINC]]-Projekten nimmt PS3GRID eine Sonderstellung ein, da für die Berechnungen vordergründig die Spielekonsole Sony Playstation 3 sowie neuere NVIDIA-Grafikkarten eingesetzt werden.

== Projektbeschreibung ==

PS3GRID/GPUGRID stellt eine Supercomputer-Infrastruktur dar, die es Forschern ermöglichst dynamische biomolekulare Prozesse auf der Ebene von Atome zu visualisieren und diese somit besser zu verstehen. Verwendet wird dabei sie sogenannte Full-Atom Molecular Dynamics-Methode. Bei diesen Berechnungen werden die Abstände von mehreren 10.000 Atomen in einem simulierten Protein/Membranfragment zueinander innerhalb von sehr kurzen Zeitabständen berechnet. Üblicherweise liegen die Zeitabstände im Femtosekunden-Bereich (10E minus 15 Sekunden).
Für die Berechnung/Visualisierung von biologisch relevanten Prozessen, wie beispielsweise der Durchgang eines Ions durch einen entsprechenden Ionenkanal in der Membran einer Zelle [http://www.ps3grid.net/img/movie.gif] bedarf es einer enormen Rechenleistung. Die zu visualisierenden biologischen Prozesse laufen Üblicherweise im Bereich von hundertstel-Sekunden bis Millisekunden ab (10E minus 2 bis 10E minus 6). Um diesen Vorgang berechnen/visualisieren zu können, müssen die Abstände aller Atome in der zu untersuchenden "Probe" berechnet werden und dies zu jeder Femtosekunde. Um eine Millisekunde eines dynamischen Prozesses zu berechnen, müssen demnach ~150 Millionen mal alle Abstände aller Atome zueinander berechnet werden. Bei 30.000 Atomen, wie in dem aktuell (Stand September 2008) berechneten Kalium-Kanal GramidicinA, wird deutlich wie rechenintensiv diese Art von Berechnungen sind.

== Erfolge des Projekts ==

Am September 6, 2008 hat das Projekt PS3GRID-GPUGRID die Marke von 1.000.000 Credits pro Tag erreicht.

== Planet 3DNow! ==

Planet 3DNow! nimmt seit dem 18.07.2008 mit einem eigenen Team an PS3GRID teil; die ersten Credits gab es am 15.08.2008.

Am 10.09.2008 erreichte der grüne Planet seine ersten 1.000.000 Credits, 22 Active members waren gemeldet.

== Teilnahme ==

PS3GRID bietet derzeit 2 verschiedene Möglichkeiten der Teilname. Zum Einen natürlich mittels einer Playstation 3, welche dem Projekt auch den Namen verleiht.

Seit dem 17.07. 2008 ist es ebenfalls möglich, mittels einer CUDA-fähigen NVIDIA-Grafikkarte teilzunehmen. Geeignet sind jedoch nur jene mit "compute capabilities" Level 1.1 oder höher. Karten die auf der G80-GPU (Geforce 8800 GTS 320/640, GTX und Ultra) basieren können nicht am Projekt teilnehmen, sie unterstützen nur das "compute capability" Level 1.0.
Die Betreiber empfehlen weiterhin Karten mit mindestens 50 Streamprozessoren (Shadern).

Derzeit (September 2008) wären das demnach:

'''NVIDIA-Geforce-8-Serie:'''
96 Shader: Geforce 8800 GS
112 Shader: Geforce 8800 GT
128 Shader: Geforce 8800 GTS 512/1024 MiB

'''NVIDIA-Geforce-9-Serie:'''
64 Shader: Geforce 9600 GT
96 Shader: Geforce 9600 GSO
112 Shader: Geforce 9800 GT
128 Shader: Geforce 9800 GTX, Geforce 9800 GTX+
2x128 Shader: Geforce 9800 GX2

'''NVIDIA-Geforce-200-Serie''':
192 Shader: Geforce GTX 260
240 Shader: Geforce GTX 280

Auf Karten mit weniger Streamprozessoren läuft das Projekt ebenfalls, allerdings können die Berechnungszeiten dann die 4 Tage betragende Deadline überschreiten.

Weiterhin notwendig ist ein [http://www.nvidia.com/object/cuda_get.html CUDA-fähiger Treiber] von NVIDIA sowie ein BOINC-Client mit einer Versionsnummer ab [http://boinc.berkeley.edu/dl/?C=M;O=D 6.3.10.] . Empfohlen werden für Treiber und BOINC-Client jeweils die aktuellsten Versionen.

'''''Update :''''' seit dem 12.09.2008 wird für die Gridberechnung unter Linux ''kein'' kompletter Kern mehr beansprucht! Windows User müssen noch warten bis der 6.3.11´er Boinc Manager da ist.

Grafiktreiber und BOINC-Client werden nun installiert, das Vorgehen kann je nach Betriebssystem bzw. Distribution variieren.
Unter Linux gilt es zu beachten, dass der Benutzer, der BOINC startet, auch Mitglied der Gruppe ''video'' sein muss. Heißt der Benutzer etwa ''boinc'', ist dieses mit dem Befehl ''usermod -G video boinc'' umgehend erledigt. Ist der Benutzer nicht Mitglied dieser Gruppe, wird die Grafikkarte nicht als Coprozessor erkannt.

Für Windows ist noch anzumerken, dass bei der Installation von BOINC der getrennte Speicherbereich deaktiviert werden muss, da sonst BOINC beim Start diese Meldung anzeigt:

26.08.2008 10:58:57 [---] CUDA devices found
26.08.2008 10:58:57 [---] Coprocessor: Device Emulation (CPU) (1)

'''''Achtung:''''' Da der getrennte Speicherbereich nachträglich nicht deaktiviert werden kann, muss der BOINC-Client neu installiert werden. Siehe dazu auch [[Portal:BOINC/Installation/Windows#Installation_des_Clients_(ab_Version_6.x.x)|Installation des BOINC-Clients 6.x.x]]

Wenn alles richtig eingerichtet ist, zeigt BOINC nun bei jedem Start eine Nachricht wie die folgende an:

14-Aug-2008 19:04:53 [---] CUDA devices found
14-Aug-2008 19:04:53 [---] Coprocessor: GeForce 9800 GT (1)

Nun kann der Computer über die Anmeldeadresse [http://www.ps3grid.net/ http://www.ps3grid.net/] dem Projekt beitreten. Daraufhin erhält er pro und GPU-Kern jeweils eine [[Work-Unit]]. Aktuell wird jeweils 1 CPU-Kern zusätzlich zum GPU-Kern belegt. Laut Betreiberauskunft wird das in zukünftigen Programmversion nicht mehr der Fall sein. Der zusätzlich von der PS3GRID-Applikation belegte CPU-Kern arbeitet dann wieder unabhängig vom GPU-Kern und kann somit für weitere BOINC-Projekte rechnen.

== Rechenzeiten ==

{| class="dcw_fullWidthTable"
! class="dcw_normalTableCell" | '''Kartenbezeichnung'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Chiptakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Shadertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Speichertakt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''OS'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Treiber'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''PS3GRID App'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Rechenzeit'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Zeit pro Schritt'''
! class="dcw_normalTableCell" | '''Benutzer'''
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce GTX 280
! class="dcw_normalTableCell" | 684Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1458Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1296Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 25150s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5503 indiana@seti]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1484Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 29576s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=3961 JKuehl]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Sparkle Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1750Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 31734s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_host_detail.php?hostid=7652 FeuerKater]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Colorful GTX 260
! class="dcw_normalTableCell" | 675Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.450Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1.215Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 32705s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5877 HGW]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 796Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1976hz
! class="dcw_normalTableCell" | 1137Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit Ultimate
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 33567s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5402 woever]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte 9800GTX+
! class="dcw_normalTableCell" | 740Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1836Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1100Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit HomePre.
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36550s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=6077 JagDoc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Leadtek Geforce 8800 GTS 512 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 725 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36700s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 8800 GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 750MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1806MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1000MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.35
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 36761s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5615 Pjack]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | PNY Geforce 8800 GT 256 MB
! class="dcw_normalTableCell" | 650 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1800 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 850 Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Vista 32 bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.92
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 43400s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5895 rapt0r]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 729MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP2 32bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.98
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 44800s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/results.php?hostid=8437 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Zotac Geforce 8800GTS
! class="dcw_normalTableCell" | 650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1650Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 972Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 46000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | MSI Geforce 8800GTS 512
! class="dcw_normalTableCell" | 730MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1838MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 972MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 53,181ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gigabyte Geforce 8800GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | 900Mhz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.42
! class="dcw_normalTableCell" | 49000s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5264 Heavy-ions@boinc]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | Gainward Geforce 9800 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1512MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | Linux 64bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.70
! class="dcw_normalTableCell" | 6.44
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | 69,402 ms
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5044 koschi]
|-
! class="dcw_normalTableCell" | inno3D Geforce 9600 GT
! class="dcw_normalTableCell" | 650MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 1600MHz
! class="dcw_normalTableCell" | 900MHz
! class="dcw_normalTableCell" | XP SP3 32-Bit
! class="dcw_normalTableCell" | 177.84
! class="dcw_normalTableCell" | 6.43
! class="dcw_normalTableCell" | 86191s
! class="dcw_normalTableCell" |
! class="dcw_normalTableCell" | [http://www.ps3grid.net/show_user.php?userid=5858 Nero24]
|}

== Banner ==

[[Bild:Banner PS3GRID.jpg]]

== Nutzung aller Cores (x CPU + x GPU)
folgende Änderung ist notwendig, bis ein angepasster Boinc-Client herausgebracht wird.

Durch Verwendung eines Flags in der cc_config.xml kann man z.B. bei einem Quad Core "5" Kerne crunchen lassen. Sprich 4x CPU 1x GPU. (Sonst nur 3x CPU 1x GPU möglich).

Zuerst den Boincmanager / Boinc komplett schließen.

Falls die Datei''' cc_config.xml''' nicht in eurem boinc-ordner existiert, einfach anlegen (einfache Textdatei z.B. mit Notepad, Editor, Wordpad).

----
<cc_config>
<options>
<ncpus>8</ncpus>
</options>
</cc_config>
----

Danach den Boincmanager / Boinc neu starten. Man sollte nun unter Meldungen die Meldung "Reading preferences override file" sehen und unter "Aufgaben" dass alle Kerne rechnen.

== Weblinks ==

* [http://www.ps3grid.net www.ps3grid.net] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://www.ps3grid.net/team_display.php?teamid=598 Planet 3DNow! Teamstatistik]

{{NaviBlock
|Vorlage:Navigationsleiste BOINC
|Navigationsleiste Nicht-BOINC
}}

[[Kategorie:Chemie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]

GPUGRID

2008-09-08T11:39:49Z

JKuehl: /* Rechenzeiten */

GPUGRID

2008-09-08T11:38:56Z

JKuehl: /* Rechenzeiten */

BoincView

2007-06-21T14:30:48Z

JKuehl: /* Konfiguration der Clients: */

'''BoincView''' ist ein Programm zur zentralen Verwaltung von Rechnern in einem Netzwer, auf welchen BOINC-Clients laufen. Es ist im Moment leider nur für Windows erhältlich.

== Installation und Konfiguration ==

=== Konfiguration der Clients: ===

# Auf jedem Client Rechner, den man per BoincView steuern will muss im BOINC-Verzeichnis eine Datei mit dem Namen remote_hosts.cfg angelegt werden. In diese Datei trägst man die IPs oder Hostnamen all derer Computer ein welchen man Zugriff zum Client erlauben will.
# Nun muss man noch das Passwort in der gui_rpc_auth.cfg Datei abändern. Diese Datei wir normalerweise vom Client automatisch angelegt, wenn sie nicht existiert und mit einem Zufallspasswort befüllt.
# Wichtig: danach Boincmgr.exe neustarten, damit dieser die Änderungen bzw. die neuen Dateien erkennt.

=== Installation von BoincView: ===
# Download der aktuellen Version
# Einen Programmordner anlegen (z.B. C:\Programme\BoincView)
# Alle Dateien in dieses Verzeichnis entpacken
# boincview.exe starten
# Die Rechner eintragen (Optionen -> Computer)

== Weblinks ==

* [http://boincview.amanheis.de/ http://boincview.amanheis.de/] Projekt Website
* [http://www.planet3dnow.de/vbulletin/showthread.php?t=289283 Forumsbeitrag - Für Großcruncher: BoincView] eine Anleitung von JKuehl

[[Kategorie:BOINC]]
[[Kategorie:Zusatzprogramme]]

Spinhenge@home

2007-03-22T12:54:57Z

JKuehl: /* Besonderheiten */

{| {{Steckbrief}}
|-
| {{Steckbrief Kategorie|Nanotechnologie}}
|-
| {{Steckbrief Betreiber|FH Bielefeld (Fachrichtung Informationstechnik)|de}}
|-
| class="dcw_characteristicsEntry" | Nationalität: || class="dcw_characteristicsData" colspan="5" | Deutschland [[Bild:Flag_de.png]]
|-
| {{Steckbrief Start|Mai 2006}}
|-
| {{Steckbrief Status Aktiv}}
|-
| {{Steckbrief Webseite|http://spin.fh-bielefeld.de|spin.fh-bielefeld.de}}
|-
| {{Steckbrief Clients Systeme}}
|-
| {{Steckbrief Clients Architektur|x86|Beta|-|-|-|-}}
|-
| {{Steckbrief P3D-Statistik|http://spin.fh-bielefeld.de|246}}
|}

'''Spinhenge@home''' ist ein Projekt der Fachrichtung Informationstechnik der Fachhochschule Bielefeld, das sich mit der Erforschung von nanomagnetischen Molekülen befasst.

== Projektbeschreibung ==

Mit Hilfe der Nanotechnologie lassen sich heute maßgeschneiderte molekulare Magneten erzeugen. Solche Moleküle sollen in Zukunft für die Produktion hochintegrierter Speicherbausteine und winziger magnetischer Schalter genutzt werden. Auch in der Medizin, bspw. der Krebsbehandlung, lassen sich solche Moleküle einsetzen.

Um diese Ziele zu erreichen, ist eine umfangreiche Untersuchung der physikalischen Eigenschaften solcher magnetischen Moleküle nötig. Die dazu notwendigen numerischen Simulationen sind sehr zeitaufwendig und werden deshalb mit Hilfe von Distributed Computing durchgeführt.

=== Erfolge des Projekts ===

TODO: Hier sollte auf bisher erzielte Erfolge und veröffentlichte Arbeiten des Projekts eingegangen werden.

=== Planet 3DNow! ===

Unser Team hat sich im letzten Jahr den ersten Platz gesichert und verteidigt ihn bis jetzt.
Anfang November 2006 hatten wir 106 Mitglieder, wie man dem Presseartikel [http://spin.fh-bielefeld.de/spin_presse.php "Schröder lässt rechnen"] entnehmen kann, da wir dort als größtes Team erwähnt werden.
Seitdem stagnierte der Zuwachs etwas, wenngleich fleißig weitergerechnet wurde. Im März 2007 allerdings bemerkten wir das die Kollegen von Seti.USA nach der Eroberung von Platz 1 bei Seti@home sich anderen Zielen zugewendet haben, insbesondere uns unsere drei ersten Plätze in Spinhenge, QMC und SIMAP (in der Reihenfolge) abzunehmen. Also erfolgte eine Motivationskampagne und innerhalb weniger Tage gelang es die Mitgliederzahl um mehr als 100 neue Mitglieder explodieren zu lassen um mit Stand 22.3.2007 nun 240 eingetragene Mitglieder zu haben. Auch haben wir unsere Credits pro Tag von ~ 11000 Anfang März 2007 auf ~ 56000 (21.3. 2007) hochschnellen lassen. Das ist allerdings momentan weniger als die Hälfte von dem was unser ärgster Verfolger Seti.USA am selben Tag produziert hat.

=== Teilnahme ===

TODO: Hinweise zu Installation und Konfiguration.

=== Besonderheiten ===

* Spinhenge unterstützt bisher keine Checkpoints. Eine nicht vollständig berechnete Workunit wird neu begonnen wenn der Boinc-Client angehalten und geschlossen wird. Die bisher investierte Arbeit verfällt. Dieses Projekt eignet sich daher weniger für Rechner die nur kurze Betriebsphasen haben. Allerdings hält sich der Schaden durch die relativ kurzen Workunits auf aktuellen Rechnern in Grenzen. Außerdem arbeiten die Programmierer an Checkpoints in kommenden Versionen der Applikation.
* Spinhenge vergibt noch keine fixen Credits. Also hängt die Höhe der claimed credits von den Benchmarkwerten ab die der Boincmanager errechnet. Mit optimierten Clients ist hier also eine Verbesserung zu erzielen, allerdings kann auch durch extrem überhöhte Benchmarkwerte und dadurch extrem hohe claimed credits betrogen werden. Fixe credits sind in Vorbereitung.
* Bisher gibt es Spinhenge nur für Windows-Betriebssysteme.
* Das Quorum beträgt 3. Eine Workunit muss also von drei Rechnern erfolgreich berechnet werden bevor alle drei Rechner credits gutgeschrieben bekommen.
* Spinhenge profitiert erstaunlich wenig von Speicherbandbreite, CPU-Cache und Befehlssatzerweiterungen (SSE, SSE2, SSE3, MMX, 3DNow! etc). Im Verhältnis zu anderen Projekten wirkt sich hier die schiere Taktrate besonders aus. Bei gleichem Takt nehmen sich z.B. K7 mit etwa 45 Minuten bei 2,2 GHz und K8 mit etwa 35 Minuten bei 2,8GHz für eine durchschnittliche Workunit, relativ wenig in der Berechnungszeit. Spinhenge eignet sich dadurch im Vergleich mit manchen anderen Projekten recht gut für ältere Rechner.
* Allerdings scheinen AMD-CPUs hierbei bevorteilt zu sein - ein Core 2 Duo E6300 übertaktet auf 3,3 GHZ benötigt etwa 33 Minuten für eine durchschnittliche Workunit.

=== Banner ===

[[Bild:Banner_Spinhenge.png]]

=== Weblinks ===

* [http://spin.fh-bielefeld.de spin.fh-bielefeld.de] - Internetpräsenz des Projekts
* [http://spin.fh-bielefeld.de/team_display.php?teamid=246 Planet 3DNow! Teamstatistik]
* [http://www.boincstats.com/stats/team_stats.php?pr=spinhenge&st=0 boincstats.com] - Teamstatistiken bei boincstats

[[Kategorie:Nanotechnologie]]
[[Kategorie:BOINC-Projekt]]
[[Kategorie:Planet 3DNow! Team]]