Portal:Folding@Home/Cores

Folding@Home untersucht ein breites Spektrum an Problemen und verwendet dabei viele verschiedene Verfahren. Aus diesem Grund gibt es bei diesem Projekt mehrere Arten von Work-Units, die sich untereinander vor allem in den zur Lösung verwendeten Algorithmen unterscheiden. Jeder WU-Typ wird von einem eigenen Core berechnet. Insgesamt gibt es bei Folding@Home derzeit 12 Cores.

Tinker

Der Tinker Core ist der älteste Core. Er wurde inzwischen durch den moderneren Gromacs Core und seine verschiedenen Derivate abgelöst.

Details:

• Dateiname: FahCore_65.exe
• Genauigkeit: einfach
• unterstützte SIMD-Erweiterungen: keine
• SMP-Unterstützung: nein
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)
  • Linux (x86)
  • MacOS X (PowerPC)

Gromacs

Der Gromacs Core hat zusammen mit seinen Derivaten den Tinker Core abgelöst und ist nun der am häufigsten verwendete Core. Er basiert auf der gleichnamigen Anwendung, welche von der University of Groningen unter der GPL-Lizenz entwickelt wird. Er kann die SIMD-Erweiterungen moderner CPUs nutzen.

Gromacs ist die Abkürzung für Groningen Machine for Chemical Simulations.

Details:

• Dateiname: FahCore_78.exe
• Genauigkeit: einfach
• unterstützte SIMD-Erweiterungen:
  • SSE
  • 3DNow!
  • AltiVec
• SMP-Unterstützung: nein
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)
  • Linux (x86)
  • MacOS X (PowerPC)

Double Gromacs

Der Double Gromacs Core ist ein Derivat des Gromacs Cores, welches doppelte statt einfacher Genauigkeit verwendet.

Details:

• Dateiname: FahCore_79.exe
• Genauigkeit: doppelt
• unterstützte SIMD-Erweiterungen:
  • SSE2
• SMP-Unterstützung: nein
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)
  • Linux (x86)
  • MacOS X (PowerPC)

Double Gromacs B

Der Double Gromacs B Core ist ein Derivat des Double Gromacs Cores, welches um einige wissenschaftliche Verfahren erweitert wurde.

Details:

• Dateiname: FahCore_7B.exe
• Genauigkeit: doppelt
• unterstützte SIMD-Erweiterungen:
  • SSE2
• SMP-Unterstützung: nein
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)?
  • Linux (x86)?
  • MacOS X (PowerPC)?

GBGromacs

Der GBGromacs Core ist ein Derivat des Gromacs Cores, welches um das "Generalized Born implicit solvent"-Verfahren erweitert wurde.

GBGromacs ist die Abkürzung für Generalized Born Gromacs.

Details:

• Dateiname: FahCore_7A.exe
• Genauigkeit: einfach(?)
• unterstützte SIMD-Erweiterungen: ?
• SMP-Unterstützung: nein
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)
  • Linux (x86)
  • MacOS X (PowerPC)

Gromacs 33

Der Gromacs 33 Core ist ein aktualisierter Gromacs Core. Er basiert auf Version 3.3 der Gromacs-Anwendung der University of Groningen.

Details:

• Dateiname: FahCore_A0.exe
• Genauigkeit: einfach(?)
• unterstützte SIMD-Erweiterungen:
  • SSE
• SMP-Unterstützung: nein
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)
  • Linux (x86)
  • MacOS X (x86)

Gromacs SREM

Der Gromacs SREM Core ist ein Derivat des Gromacs Cores, welches um das "Replica Exchange"-Verfahren erweitert wurde.

SREM ist die Abkürzung für Serial Replica Exchange Method.

Details:

• Dateiname: FahCore_80.exe
• Genauigkeit: einfach(?)
• unterstützte SIMD-Erweiterungen: ?
• SMP-Unterstützung: nein
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)
  • Linux (x86)

Gromacs Simulated Tempering

Der GROSimT Core ist ein Derivat des Gromacs Cores, welches um den "Simulated Tempering"-Algorithmus erweitert wurde.

Details:

• Dateiname: FahCore_81.exe
• Genauigkeit: einfach(?)
• unterstützte SIMD-Erweiterungen: ?
• SMP-Unterstützung: nein
• unterstützte Plattformen:
  • Linux (x86)

Gromacs SMP

Der Gromacs SMP Core ist ein Derivat des Gromacs Cores, welches für Multiprozessorsysteme (SMP) angepasst wurde. Der Core benötigt ein System mit mindestens zwei Prozessorkernen. Optimiert wurde er auf 4 Kerne.

Details:

• Dateiname: FahCore_A1.exe
• Genauigkeit: einfach
• unterstützte SIMD-Erweiterungen:
  • SSE
• SMP-Unterstützung: ja
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)
  • Linux (x86-64)
  • MacOS X (x86)

GPU Gromacs

Der GPU-Client verwendet einen Core, der im Wesentlichen ein sehr stark veränderter Gromacs Core ist. Er läuft nicht auf der CPU, sondern nutzt die Shader moderner Grafikchips, welche aufgrund ihrer sehr starken Spezialisierung um ein vielfaches schneller sind als eine CPU.

Derzeit werden nur Grafikchips von ATI/AMD unterstützt. Eine Version für NVIDIA-Chips ist geplant.

Details:

• Dateiname: FahCore_10.exe
• Genauigkeit: einfach
• SMP-Unterstützung: ja (Crossfire)
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)
• unterstützte Grafikchips:
  • AMD R520 (X1800)
  • AMD RV530 (X1650)
  • AMD RV570 (X1650 XT, X1950)
  • AMD R580 (X19xx)

AMBER

Der AMBER Core ist ein Programm zur Berechnung von Moleküldynamiken, welches ursprünglich von der University of California entwickelt wurde und nun vom Scripps Research Institute weiterentwickelt wird.

AMBER ist die Abkürzung für Assisted Model Building and Energy Refinement.

Details:

• Dateiname: FahCore_82.exe
• Genauigkeit: doppelt
• unterstützte SIMD-Erweiterungen: keine (SSE2 geplant)
• SMP-Unterstützung: nein
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)
  • Linux (x86)

QMD

Der QMD Core nutzt einen quantenchemischen Ansatz und basiert auf dem CPMD-Programm, welches von verschiedenen weltweit verteilten Einrichtungen entwickelt wird. Er ist Multithreading-fähig.

Da der verwendete Intel Fortran Compiler auf AMD-CPUs absichtlich kein SSE2 verwendet und Intel es nicht erlaubt, diese Einschränkung zu umgehen, laufen QMD-WUs auf AMD-Prozessoren sehr langsam. Sie werden deshalb nur an Systeme mit einer Intel-CPU verteilt.

Details:

• Dateiname: FahCore_96.exe
• Genauigkeit: doppelt
• unterstützte SIMD-Erweiterungen:
  • SSE2
• SMP-Unterstützung: ja
• unterstützte Plattformen:
  • Windows (x86)
  • Linux (x86)