The Lattice Project: Unterschied zwischen den Versionen

Aus Planet 3DNow! Distributed Computing Wiki
Zur Navigation springen Zur Suche springen
(Livestats eingebaut)
(→‎Projektbeschreibung: Projektbeschreibung entfernt (Copyright!); Beschreibung von GARLI entfernt (war nur eine ganz allgemeine Beschreibung eines genet. Alg.); Überschriften als solche geschrieben)
Zeile 32: Zeile 32:
  
 
== Projektbeschreibung ==
 
== Projektbeschreibung ==
The Lattice Project ist ähnlich wie das World Community Grid kein eigenständiges Distributed Computing Projekt, sondern eine komplexe Grid-Infrastruktur, die von Forschern der Universität von Maryland entwickelt wurde und in der diverse Projekte ablaufen können. Das Interessante an Lattice Project ist die Verschmelzung von GLOBUS mit Condor und BOINC. Seit Entwicklungsbeginn im Jahre 2003 sind insgesamt 21 bereits existierende Bioinformatik-Tools auf das Lattice Project portiert worden. Darunter sind unter anderem Sequenzalignmentprogramme wie BLAST und ClustalW, Programme zur Vorhersage von RNA Strukturen (Pknots), sowie eine ganze Serie von Tools zur phylogenetischen Analyse (PAUP, LAMARC, PHYLM, usw.). Hintergrund dieser Bemühungen ist der immense Rechenbedarf moderner bioinformatischer Analysen.
 
  
'''Hauptziel:'''
+
=== Hauptziel ===
  
 
Das Arbeitsumfeld vieler Wissenschaftler ist meist grundsätzlich unzulänglich, was den Fortschritt in einer Vielzahl von Forschungsfeldern materiell behindert. Es ist das Ziel genügend Rechenleistung und Ressourcen für eine aktive Gemeinschaft von wissenschaftlichen Forschern zur Verfügung zu stellen.
 
Das Arbeitsumfeld vieler Wissenschaftler ist meist grundsätzlich unzulänglich, was den Fortschritt in einer Vielzahl von Forschungsfeldern materiell behindert. Es ist das Ziel genügend Rechenleistung und Ressourcen für eine aktive Gemeinschaft von wissenschaftlichen Forschern zur Verfügung zu stellen.
  
  
'''Wann wird das Lattice Project beendet?'''
+
=== Wann wird das Lattice Project beendet? ===
  
 
Als fortwährendes Forschungsprojekt, das Lattice Project wird in vielerlei Hinsicht nie beendet werden. Dennoch kann die gegenwärtige Lage ständig als Kreuz zwischen Prüfung und Fertigung beschrieben werden. Sie können den Fortschritt der Services, welche dem Berechnungsrasterfeld hinzugefügt worden sind, auf der Rasterfeld Serviceseite verfolgen. Zusätzlich werden alle Neuigkeiten auf der Newsseite bekanntgegeben, sobald es welche gibt.
 
Als fortwährendes Forschungsprojekt, das Lattice Project wird in vielerlei Hinsicht nie beendet werden. Dennoch kann die gegenwärtige Lage ständig als Kreuz zwischen Prüfung und Fertigung beschrieben werden. Sie können den Fortschritt der Services, welche dem Berechnungsrasterfeld hinzugefügt worden sind, auf der Rasterfeld Serviceseite verfolgen. Zusätzlich werden alle Neuigkeiten auf der Newsseite bekanntgegeben, sobald es welche gibt.
  
  
'''Welche Projekt - WU (Name) tut was? (Aktuell)'''
+
=== Beschreibung ===
 
 
''GARLI (Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference - Genetischer Algorithmus der Rückschlüsse aufgrund von Wahrscheinlichkeiten trifft)''
 
 
 
 
 
'''Beschreibung:'''
 
  
 
Führt eine heuristische phylogenetische Suche der Nukleotidsubstitution durch. Dabei wird das GTR-Modell verwendet - Vergleiche mit dem bekannten PAUP sind möglich. Laut Website erfolgt die Analyse mit Maximum Likelihood. Screenshots und mehr Erklärungen finden sich auf der dortigen Website.
 
Führt eine heuristische phylogenetische Suche der Nukleotidsubstitution durch. Dabei wird das GTR-Modell verwendet - Vergleiche mit dem bekannten PAUP sind möglich. Laut Website erfolgt die Analyse mit Maximum Likelihood. Screenshots und mehr Erklärungen finden sich auf der dortigen Website.
  
  
'''Für Laien:'''
+
=== Für Laien ===
  
erstellt Stammbäume von verwandten Organismen aufgrund von Gensequenzen.
+
Erstellt Stammbäume von verwandten Organismen aufgrund von Gensequenzen.
  
  
'''Stichworte:'''
+
=== Stichworte ===
  
 
Maximum Likelihood, Parsimony und Distanzmethoden.
 
Maximum Likelihood, Parsimony und Distanzmethoden.
  
  
=== Erfolge des Projekts ===
+
== Erfolge des Projekts ==
  
 
TODO: Hier sollte auf bisher erzielte Erfolge und veröffentlichte Arbeiten des Projekts eingegangen werden.
 
TODO: Hier sollte auf bisher erzielte Erfolge und veröffentlichte Arbeiten des Projekts eingegangen werden.
  
=== Planet 3DNow! ===
+
== Planet 3DNow! ==
  
 
Planet 3DNow! nimmt seit dem 14.06.2007 mit einem eigenen Team an The Lattice Project teil.
 
Planet 3DNow! nimmt seit dem 14.06.2007 mit einem eigenen Team an The Lattice Project teil.
Zeile 74: Zeile 68:
 
TODO: Hier sollte auf unser Team bei diesem Projekt eingegangen werden.
 
TODO: Hier sollte auf unser Team bei diesem Projekt eingegangen werden.
  
=== Teilnahme ===
+
== Teilnahme ==
  
 
TODO: Hinweise zu Installation und Konfiguration.
 
TODO: Hinweise zu Installation und Konfiguration.
  
=== Banner ===
+
== Banner ==
  
 
[[Bild:Banner_Lattice.png]]
 
[[Bild:Banner_Lattice.png]]
Zeile 84: Zeile 78:
 
[[Bild:Banner_Lattice2.png]]
 
[[Bild:Banner_Lattice2.png]]
  
=== Weblinks ===
+
== Weblinks ==
  
 
* [http://boinc.umiacs.umd.edu/ boinc.umiacs.umd.edu] - Internetpräsenz des Projekts
 
* [http://boinc.umiacs.umd.edu/ boinc.umiacs.umd.edu] - Internetpräsenz des Projekts

Version vom 1. März 2008, 13:24 Uhr

Steckbrief
Kategorie: Metaprojekt
Betreiber: University of Maryland
Nationalität: USA Flag us.png
Start: 2004 (Monat?) (BOINC: November 2004?)
Status: ?
Webseite: boinc.umiacs.umd.edu
Anmelde-URL: http://boinc.umiacs.umd.edu
Clients Logo Windows.gif Logo Linux.gif Logo MacOSX.gif Logo android.png Logo raspberry.png
x86 x x x ? -
x86-64 - - x - -
PowerPC - - x - -
Planet 3DNow! Teamstatistik
Platzierung Planet 3DNow!: Ajax-loader.gif
(powered by BOINCstats)

The Lattice Project ist ein Projekt der Universität Maryland. Es ist selbst kein eigenständiges Distributed Computing Projekt, sondern stellt die Infrastruktur für eine Vielzahl von Projekten der Bioinformatik.

Projektbeschreibung

Hauptziel

Das Arbeitsumfeld vieler Wissenschaftler ist meist grundsätzlich unzulänglich, was den Fortschritt in einer Vielzahl von Forschungsfeldern materiell behindert. Es ist das Ziel genügend Rechenleistung und Ressourcen für eine aktive Gemeinschaft von wissenschaftlichen Forschern zur Verfügung zu stellen.


Wann wird das Lattice Project beendet?

Als fortwährendes Forschungsprojekt, das Lattice Project wird in vielerlei Hinsicht nie beendet werden. Dennoch kann die gegenwärtige Lage ständig als Kreuz zwischen Prüfung und Fertigung beschrieben werden. Sie können den Fortschritt der Services, welche dem Berechnungsrasterfeld hinzugefügt worden sind, auf der Rasterfeld Serviceseite verfolgen. Zusätzlich werden alle Neuigkeiten auf der Newsseite bekanntgegeben, sobald es welche gibt.


Beschreibung

Führt eine heuristische phylogenetische Suche der Nukleotidsubstitution durch. Dabei wird das GTR-Modell verwendet - Vergleiche mit dem bekannten PAUP sind möglich. Laut Website erfolgt die Analyse mit Maximum Likelihood. Screenshots und mehr Erklärungen finden sich auf der dortigen Website.


Für Laien

Erstellt Stammbäume von verwandten Organismen aufgrund von Gensequenzen.


Stichworte

Maximum Likelihood, Parsimony und Distanzmethoden.


Erfolge des Projekts

TODO: Hier sollte auf bisher erzielte Erfolge und veröffentlichte Arbeiten des Projekts eingegangen werden.

Planet 3DNow!

Planet 3DNow! nimmt seit dem 14.06.2007 mit einem eigenen Team an The Lattice Project teil.

TODO: Hier sollte auf unser Team bei diesem Projekt eingegangen werden.

Teilnahme

TODO: Hinweise zu Installation und Konfiguration.

Banner Lattice.png

Banner Lattice2.png

Weblinks


BOINC-Projekte

- Astronomie & Astrophysik -

Cosmology@Home | Einstein@Home | MilkyWay@home | orbit@home | SETI@home

- Biologie & Medizin -

BCL@Home | Cels@Home | Docking@Home | DrugDiscovery@Home | Malariacontrol.net | POEM@HOME | Predictor@home* | Proteins@Home | RNA World | Rosetta@home | SIMAP | Superlink@Technion | TANPAKU* | Virtual Prairie

- Chemie -

GPUGRID | Hydrogen@Home | QMC@Home

- Geologie -

Quake-Catcher Network

- Internet -

Anansi | DepSpid*

- Kryptographie -

DistrRTgen | DNETC@HOME | Enigma@Home | SHA-1 Collision Search Graz

- Künstliche Intelligenz -

Artificial Intelligence System* | distributedDataMining | FreeHAL@home | MindModeling@Home

- Mathematik -

3x+1@home* | ABC@home | Collatz Conjecture | Goldbach's Conjecture Project | Genetic Life | NFS@Home | PrimeGrid | Ramsey@Home | Rectilinear Crossing Number | Riesel Sieve* | SZTAKI Desktop Grid | TSP* | WEP-M+2 Project

- Metaprojekte -

AlmereGrid | Leiden Classical | The Lattice Project | World Community Grid | yoyo@home

- Meteorologie -

APS@Home | BBC Climate Change Experiment* | ClimatePrediction.net | Climate Prediction Seasonal Attribution Project

- Nanotechnologie -

NanoHive@Home* | Spinhenge@home

- Physik -

AQUA@home | EDGeS@Home | IBERCIVIS | LHC@home | Magnetism@home | QuantumFIRE | Zivis Superordenador Ciudadano* | µFluids@Home

- Rendering -

BURP | PicEvolvr | Open Rendering Environment

- Spiele -

Chess960@Home | NQueens@Home | pPot Tables* | Sudoku

- Tests der BOINC-Plattform -

Pirates@Home | Project Neuron* | UCT: malariacontrol.net | vtu@home


* Beendetes Projekt
Nicht-BOINC-Projekte

- Astronomie & Astrophysik -

SETI@home Classic*

- Biologie & Medizin -

Folding@Home | Lifemapper*

- Mathematik -

RC5-72


* Beendetes Projekt