RNA World – Planet 3DNow! Distributed Computing Wiki

Steckbrief
Kategorie:	Biologie & Medizin
Betreiber:	Rechenkraft.net e.V., Philipps-Universität Marburg, Indian Institute of Science Bangalore
Nationalität:	Deutschland
Start:	November 2009
Status:	Beta
Webseite:	rnaworld.de/rnaworld/
Anmelde-URL:	http://rnaworld.de/rnaworld/
Clients
x86	x	x	-	-	-
x86-64	x	x	-	-	-
Planet 3DNow! Teamstatistik
Platzierung Planet 3DNow!: (powered by BOINCstats)

Dieser Artikel ist ausbaufähig. Eine Mitarbeit ist insbesondere bei den Abschnitten Einleitung, Beschreibung, Steckbrief, Erfolge erwünscht

Projektbeschreibung

RNA World ist ein Projekt, das zur Identifizierung, Analyse, Strukturvorhersage und zum Design von RNA Molekülen auf der Basis etablierter Bioinformatiksoftware im Hochleistungs- und Hochdurchsatzverfahren dient. Damit soll die Forschung neuer Medikamente vorangetrieben werden. Betrieben wird RNA World von der Deutschen Vereinigung Rechenkraft.net e.V. Nach eigenen Angaben "strebt RNA World keinen Profitgewinn an, setzt ausschließlich Open Source Code ein und wird seine Ergebnisse der Öffentlichkeit zugänglich machen."

Erfolge des Projekts

TODO

Planet 3DNow!

Planet 3DNow! nimmt seit dem 24.12.2009 mit einem eigenen Team an RNA World teil. Im September 2010 wurde ein Race gegen SETI.Germany gestartet. Ausgangslage: SETI.Germany auf Platz 3 mit ca. 2,7 Mio. Credits, Planet 3DNow! auf Platz 5 mit ca. 2,4 Mio. Credits. Z.Zt. (12.03.2011) hält das Team Planet 3DNow! den ersten Platz mit gut 29 Millionen Credits. Das Team von Rechenkraft.net liegt aber nur gut 400.000 Credits dahrinter.

Teilnahme

TODO

Besonderheiten

Das Projekt unterstützt derzeit kein Checkpointing. Daher muss - besonders bei Berechnung der langen sog. INTRON-Workunits - gewährleistet sein, dass der Rechner 24/7 in Betrieb ist. Nicht fertig gerechnete WUs starten nach jeder Unterbrechung neu. Auch der Punkt "lasse anwendung in speicher, wenn sie pausiert" muss aktiviert sein, um einen Neustart zu unterbinden. Ein Wechsel der Anwendungen sollte möglichst vermieden werden.

Das Projekt-Team von Rechenkraft.net liefert im Planet3DNow!-Forum einen hervorragenden Support[1].