Rosetta@home – Planet 3DNow! Distributed Computing Wiki

Steckbrief
Kategorie:	Biologie & Medizin
Betreiber:	University of Washington (Fachrichtung Biochemie)
Nationalität:	USA
Start:	September 2005
Status:	Stabil
Webseite:	boinc.bakerlab.org/rosetta/
Webseite (Alpha):	ralph.bakerlab.org
Anmelde-URL:	http://boinc.bakerlab.org/rosetta/
Anmelde-URL (Alpha):	http://ralph.bakerlab.org/
Clients
x86	x	x	x	-	-
x86-64	x	x	x	-	-
PowerPC	-	-	x	-	-
Planet 3DNow! Teamstatistik
Planet 3DNow! Teamstatistik (Alpha)

Rosetta@home ist ein Projekt der Universität zu Washington und beschäftigt sich mit der Untersuchung der dreidimensionalen Struktur von Eiweißen (Proteinen) um Heilmittel für Krankheiten wie Malaria, HIV, Krebs und andere schwere Krankheiten zu finden.

Projektbeschreibung

TODO - genauere Projektbeschreibung

Erfolge des Projekts

TODO - wesentliche Erfolge des Projekts

Planet 3DNow!

Planet 3DNow! nimmt seit dem 09.09.2006 mit einem eigenen Team an Rosetta@home teil.

TODO - Teamgeschichte bei Rosetta

Teilnahme

Sollte der BOINC-Client noch nicht installiert sein, kann er von boinc.bakerlab.org heruntergeladen und installiert werden. Für Fragen zur Installation des BOINC-Clienten steht der Teil Windows-Installation von BOINC mit Text und Bildern zur Verfügung.

Um Rosetta@home nun als Projekt anzumelden, muss der BOINC-Manager geöffnet werden. In der Menüleiste wird der Eintrag "Assistenten" und dann "Projekt anmelden" ausgewählt. Im sich dann öffnenden Fenster wird die "Anmelde-URL" aus dem obigen Steckbrief eingegeben.

Wenn noch kein Rosetta-Account vorhanden ist, wird dieser nun unter der Auswahl des ersten Punktes "Nein, neues Teilnehmerkonto" erstellt. Dazu wird die Emailadresse und das gewünschte Passwort eingegeben und bestätigt. In den Account kann man sich nun über boinc.bakerlab.org/rosetta/home.php einloggen und dort Änderungen an den Einstellungen vornehmen. Siehe auch BOINC Konfiguration.
Dies ist vor allen Dingen bei der Erstellung eines "neuen" Accounts wichtig, da man dann gleich unter "Account information" seinen Namen, unter dem man später in den Statistiken zu finden ist, eingeben bzw. ändern kann. Weiterhin ist es auf der Seite Planet 3DNow! Teamstatistik unter "Join this team" möglich dem Planet 3DNow! Team beizutreten und es tatkräftig bei Rosetta@home zu unterstützen.
Wenn schon ein Rosetta-Account vorhanden ist, weil einfach nur das Betriebssystem neu installiert worden ist oder ein weiterer Rechner für den gleichen Rosetta-Account rechnen soll, dann wird der zweite Punkt "Ja, existierendes Teilnehmerkonto" ausgewählt und Rosetta@home unter der Eingabe der Emailadresse und des Passworts auf diesem Rechner eingerichtet.

Der BOINC-Client verbindet sich dann mit dem Projekt und lädt den Client für Rosetta und die ersten Work-Units herunter.

Besondere Einstellungen:

Im Rosetta-Account unter "Preferences" -> "Rosetta@home preferences control resource share and customize graphics" -> "Target CPU run time" kann bei Rosetta die Bearbeitungszeit der einzelnen Workunits eingestellt werden.

Zum einen entlastet eine längere Bearbeitungszeit der einzelnen WUs die Server und die eigene Internetverbindung, zum anderen enlastet sie das Projekt selber, da die gleiche WU zur vollständigen Bearbeitung nicht mehr so oft verschickt werden muss. Zusätzlich stehen die Daten dann auch noch dem Projekt früher zur Verfügung.

Ist der Rechner beispielsweise regelmäßig 12 h/Tag angeschaltet, dann kann bei "Target CPU run time" die Zeit von 12 Stunden eingegeben werden und der Rechner erhält dann 1-2 WUs von ca 5 MB. Eine WU wird dann 12 h berechnet. Der Standardwert ist 3 h und würde dann 4-5 WUs von ca. 5 MB entsprechen, wobei eine WU dann nur 3 h berechnet wird. Diese Angaben gelten für einen Single-Core Prozessor und Standardeinstellungen. An diesem Beispiel kann man auch sehen, dass diese WU dann dreimal weniger an andere Rechner verschickt werden muss, um die restlichen Strukturen zu berechnen.